Phylogenetic Position of Xenoturbella bocki and Hemichordates Balanoglossus carnosus and Saccoglossus kowalevskii Based on Amino Acid Composition or Nucleotide Content of Complete Mitochondrial Genomes
Notice bibliographique
Résumé
To clarify the phylogenetic position of Xenoturbella bocki and hemichordates (Balanoglossus carnosus and Saccoglossus kowalevskii), which occupy an ambiguous evolutionary position between vertebrates and invertebrates, we expanded a pre-existing baseline vertebrate data set by incorporating randomly selected invertebrates. Based on nucleotide content calculated from complete mitochondrial genomes, invertebrates were classified into two groups, high C/G and low C/G, with vertebrates placed within the high-C/G invertebrate group. X. bocki and hemichordates (B. carnosus and S. kowalevskii) also fell into the high-C/G invertebrate group. We also analyzed amino acid composition and nucleotide content of complete mitochondrial genomes or 16S rRNA genes using Ward’s clustering method and neighbor-joining. In the resulting phylogenetic trees, invertebrates are classified into high C/G and low C/G categories, and vertebrates are divided into terrestrial and aquatic groups. In addition, X. bocki and representative hemichordates B. carnosus and S. kowalevskii appear to be more closely related to vertebrates than to invertebrates.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».