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Enregistrement W2032027191 · doi:10.5539/ijb.v6n1p82

Phylogenetic Position of Xenoturbella bocki and Hemichordates Balanoglossus carnosus and Saccoglossus kowalevskii Based on Amino Acid Composition or Nucleotide Content of Complete Mitochondrial Genomes

2013· article· en· W2032027191 sur OpenAlexvenueno aff
Kenji Sorimachi, Teiji Okayasu, Yoshifumi Ebara, Emiko Furuta, Shuji Ohhira

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Biology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIdentification and Quantification in Food
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyPhylogenetic treeInvertebrateVertebrateGenomeMitochondrial DNAGeneticsGenePhylogeneticsEvolutionary biologyZoologyEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To clarify the phylogenetic position of Xenoturbella bocki and hemichordates (Balanoglossus carnosus and Saccoglossus kowalevskii), which occupy an ambiguous evolutionary position between vertebrates and invertebrates, we expanded a pre-existing baseline vertebrate data set by incorporating randomly selected invertebrates. Based on nucleotide content calculated from complete mitochondrial genomes, invertebrates were classified into two groups, high C/G and low C/G, with vertebrates placed within the high-C/G invertebrate group. X. bocki and hemichordates (B. carnosus and S. kowalevskii) also fell into the high-C/G invertebrate group. We also analyzed amino acid composition and nucleotide content of complete mitochondrial genomes or 16S rRNA genes using Ward’s clustering method and neighbor-joining. In the resulting phylogenetic trees, invertebrates are classified into high C/G and low C/G categories, and vertebrates are divided into terrestrial and aquatic groups. In addition, X. bocki and representative hemichordates B. carnosus and S. kowalevskii appear to be more closely related to vertebrates than to invertebrates.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,055
Score d'incertitude au seuil0,396

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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