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Enregistrement W2032239134 · doi:10.1109/nafips.2008.4531324

A choquet integral-based multi-class classifier and its applications on the prediction of membrane protein types

2008· article· en· W2032239134 sur OpenAlex
Carlos Alberto V. Campos, Lourdes Pelayo

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMachine Learning in Bioinformatics
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChoquet integralClassifier (UML)Artificial intelligenceClass (philosophy)Fuzzy logicIntegral membrane proteinMachine learningType (biology)Computer sciencePattern recognition (psychology)Computational intelligenceMathematicsData miningMembrane proteinMembraneBiologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In this paper, a novel aggregator information-based strategy for predicting membrane proteins types is introduced. In particular, we propose a framework of five Choquet Integrals (one Choquet Integral for each protein type) that are specialized to compute the global score of each class of proteins. These global scores are obtained by the combination of the partial evaluations of several membrane protein features provided by different individual classifiers. To compute the fuzzy measures associated with each Choquet Integral, we use a new unsupervised method (International Journal of Intelligent Systems, January 2008) proposed in the literature in which the concept of importance of attributes (in our case, the importance of the subsets of the classifiers) is replaced by that of information content in the subsets of classifiers. The parameters of the individual classifiers are adjusted with a conventional training dataset of 2059 sequences of aminoacids where 435 are Type I, 152 Type II, 1311 are multipass trans-membrane, 51 lipid-chain-anchored and 110 GPI-anchored type. The results obtained in this experiment, shows that our proposed method obtains a higher classification accuracy compared with the results obtained for several methods cited in the literature.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,122
Score d'incertitude au seuil0,207

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

En bref

Citations0
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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