Optimization of PCR Conditions for DNA Amplification of Common Buckwheat Using EST Primers
Notice bibliographique
Résumé
Under optimal conditions the PCR reaction is very efficient; microgram quantities may be synthesized from a single molecule of substrate DNA. DNA of four lines of common buckwheat (Kyusu, Canada, Miyazaki and Botansoba) was used to optimize PCR reaction and cycling program of 26 primers for DNA amplification of common buckwheat. Annealing temperature (Ta), PCR cycle number and MgCl2 concentration were considered optimum if the single clear band was observed. Of the 26 primers Ta of only 10 primers could be optimized. Three primer pairs performed best at Ta of 54°C. The optimum concentration of MgCl2 was found to be 1.5mM for all primer pairs. Similarly the number of PCR cycles was found to be 40 for all 10 primer pairs except for primer pair 57. Optimized PCR conditions were used for subsequent studies such as transferability of EST primers to other Fagopyrum species and construction of linkage map.Nepal Agric. Res. J. Vol. 8, 2007, pp. 1-6DOI: http://dx.doi.org/10.3126/narj.v8i0.11563
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».