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Enregistrement W2032643022 · doi:10.1021/pr0701658

Proteomic Analysis of Human Cervico-Vaginal Fluid

2007· article· en· W2032643022 sur OpenAlex
Julie Shaw, Christopher R. Smith, Eleftherios P. Diamandis

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of Proteome Research · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueAdvanced Proteomics Techniques and Applications
Établissements canadiensUniversity of TorontoMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProteasesProteomeKallikreinProteomicsBiologyChemistryBiochemistryEnzymeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Human cervico-vaginal fluid (CVF) is a mixture of fluids originating from the vagina, cervix, endometrium, and oviduct. CVF has been shown to play an important role in protecting the vagina from infection. We used "bottom-up" proteomic approaches to characterize the protein repertoire of human CVF. We applied two different sample prefractionation methods, one-dimensional-SDS-PAGE (1D-SDS-PAGE) and strong cation-exchange chromatography, followed by LC-MS/MS and bioinformatic analysis. We identified a total of 685 proteins. Strong cation-exchange chromatography prefractionation resulted in a larger number of proteins identified when compared with 1D-SDS-PAGE. Extracellular or membrane proteins made up 30% of the proteins identified, according to Genome Ontology (GO) classifications. We confirmed the presence of defense-related proteins, such as haptoglobin, defensins, and lactoferrin; and identified new ones such as azurocidin and dermcidin. We also identified many serine and cysteine proteases, including 6 members of the kallikrein family (KLKs 6, 7, 10, 11, 12, and 13). The same KLKs were also confirmed quantitatively by ELISA assays. Knowledge of the CVF proteome will aid in the discovery of potential biomarkers for gynecological malignancies and infections and provide additional clues for its physiological functions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,878

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,064
Tête enseignante GPT0,439
Écart entre enseignants0,375 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle