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Enregistrement W2032682887 · doi:10.1139/g05-081

Linkage and mapping of resistance genes to<i>Xanthomonas axonopodis</i>pv.<i>passiflorae</i>in yellow passion fruit

2006· article· en· W2032682887 sur OpenAlexvenueno aff
Ricardo Lopes, Maria Teresa Gomes Lopes, Monalisa Sampaio Carneiro, Frederico de Pina Matta, Luís Eduardo Aranha Camargo, Maria Lúcia Carneiro Vieira

Notice bibliographique

RevueGenome · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Pathogens and Resistance
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyAmplified fragment length polymorphismPassifloraQuantitative trait locusGeneticsGenetic linkageXanthomonasLinkage (software)Gene mappingPopulationPassion fruitGenePhenotypeBotanyHorticultureChromosomeGenetic diversity

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The cultivated passion fruit (Passiflora edulis f. flavicarpa) is a cross-pollinated species native to South America. In the current study, a segregating F1 population derived from a single cross between the clones IAPAR-06 and IAPAR-123 was used to construct AFLP-based linkage maps and to map resistance genes to bacterial spot caused by Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae. Linkage analysis was performed by the 2-way pseudo-testcross mapping method using markers that segregated in a 1:1 ratio. The IAPAR-06 linkage map was constructed using 115 markers, 112 of which were allocated to 9 linkage groups (LG) covering 790.2 cM. The map of IAPAR-123 was constructed using 140 markers, 138 of which were allocated to 9 LG covering 488.9 cM. In both maps, clusters of markers were detected, indicating that the AFLP markers were not distributed at random. Bacterial resistance was assessed by measuring the diseased leaf area after wound-inoculating the leaves of F1 plants. Quantitative resistance loci (QRLs) mapping was carried out by composite interval mapping and 1 QRL was detected, which explained 15.8% of the total phenotypic variation. The possibility of considering these data for marker-assisted selection in passion fruit breeding programs is discussed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,982
Score d'incertitude au seuil0,240

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,187
Écart entre enseignants0,174 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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