Hydrophobic Substitutions in the First Residue of the CRAC Segment of the gp41 Protein of HIV
Notice bibliographique
Résumé
We investigated the peptides N-acetyl-AWYIK-amide and N-acetyl-VWYIK-amide corresponding to single amino acid substitutions in LWYIK, a segment found in the gp41 protein of HIV and believed to play a role in sequestering this protein to a cholesterol-rich domain in the membrane. The effects of these peptides on the thermotropic phase transitions of 1-stearoyl-2-oleoylphosphatidylcholine (SOPC) and mixtures of SOPC and cholesterol were intermediate between that having the wild-type sequence (LWYIK) and another (IWYIK), the least active peptide previously studied. This correlated with results from studies of single mutations in the gp41 protein of HIV-1, in which L679 of the LWYIK segment is replaced with either A or V, measuring the capability of TZM-BL HeLa-based HIV-1 indicator cells to form syncytia. The peptides were also comparatively analyzed in silico. All together, the results suggest that the mode of interaction of this region of gp41 with the polar heads of membrane lipids contributes to its cholesterol selectivity and that this is somehow related to the biological activity of the viral glycoprotein.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».