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Enregistrement W2032809030 · doi:10.1016/j.crci.2005.03.006

The importance of ligand–ligand interactions for molecular geometry and the ligand close-packing model

2005· article· en· W2032809030 sur OpenAlexaff
R. J. Gillespie, E. A. Robinson

Notice bibliographique

RevueComptes Rendus Chimie · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueCrystallography and molecular interactions
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLigand (biochemistry)MoleculeBond lengthGeminalSteric effectsElectronegativityAtom (system on chip)Computational chemistryChemical physicsMolecular geometryChemistryCrystallographyStereochemistryOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

It is shown that repulsions between vicinal ligands and groups can be of considerable importance in determining molecular geometry, particularly for small central atoms. The importance of such repulsions was first proposed in the 1960s for molecules with a central carbon atom but has much more recently also been shown to be the case for molecules with other small central atoms. Indeed for such molecules the ligands may be considered to be close-packed around the central atom and from the constant ligand–ligand distances in these molecules a ligand radius for the atom bonded to the central atom may be deduced. These radii decrease across the periodic table as the charge on the ligand decreases with increasing electronegativity of the central atom. It is shown that most of the exceptions to the VSEPR model for molecules with non-metal central atoms can be explained if ligand–ligand repulsions, which are not explicitly considered in the VSEPR model, are taken into account. For example, the VSEPR model predicts that the bond angle in PH 3 would be larger than in NH 3 , whereas it is in fact considerably smaller, which is entirely consistent with ligand close packing (LCP) and the small size of the hydrogen ligand. Indeed, the ligand radius enables bond angles to be predicted quantitatively if the bond length is known, whereas the VSEPR model can only make qualitative predictions. It has long been recognized that steric effects between large nearby groups, in particular geminal groups, can be of importance in determining molecular geometry and reaction rates and mechanisms. However, the effect of steric interactions between vicinal atoms or groups has not been so widely recognized. Several authors have maintained that such interactions may be of considerable importance in determining molecular geometry, although this topic has generally only been discussed in terms of the valence bond theory or the VSEPR model. The purpose of this paper is to review previous relevant work and to review and extend our recent work, which provides strong evidence for the importance of the interaction between vicinal ligands (ligand–ligand repulsion) in determining molecular geometry. This evidence led to the development of the LCP model. .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: Théorique ou conceptuel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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