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Enregistrement W2032821673 · doi:10.1158/1538-7445.am2012-4420

Abstract 4420: Serum regulates reovirus-mediated cytopathy in K-Ras activated colorectal cancer and intestinal epithelial cell lines

2012· article· en· W2032821673 sur OpenAlexaff
Radhashree Maitra, Titto Augustine, Raviraja N. Seetharam, Matthew Coffey, Lidija Klampfer, John John.Mariadason, Sanjay Goel

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer Research and Treatments
Établissements canadiensOncolytics Biotech (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésKRASMultiplicity of infectionCell cultureOncogeneColorectal cancerMolecular biologyBiologyWestern blotCancer researchMutantCell growthMTT assayCellCancerGeneCell cycleBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background: The oncolytic potency of replication competent REOvirus has been demonstrated in various cancers. The activity is most pronounced in Kras mutant cancer cells, which account for 30-40 % of all cancers. Herein we simultaneously utilized isogenic human derived colorectal cancer cell lines that differ only by the presence of mutant Kras and normal rat intestinal epithelial cells with inducible Kras to evaluate whether the presence of oncogenic Kras alters the sensitivity of colon cancer cells to reovirus. Methods: Reovirus was obtained from Oncolytics Biotech Inc. Rat IEC's harboring IPTG inducible mutant Ras oncogene (IEC-iKras) were treated with reovirus ± IPTG. The infectivity was maintained at a multiplicity of infection (MOI) of 2. MTT assay was performed at 72 hours to determine cell vability (CV). Similar experiments were also performed with HCT116 (Kras mut) and its isogenic derivative Hke3 [(Kras wild type (WT)]. Cells were cultured and treated in both serum rich (SR) and serum free (SF) media to determine the effect of growth factors on sensitivity to reovirus. Alterations in gene expression were determined by real time PCR and protein expression by western blot. Results: The activity of reovirus was observed in all cell lines studied. Reduction in CV was greater in Kras mutant HCT116 compared to WT Hke3 cells. Consistently, induction of Kras in IEC cells increased the potency of reovirus. Furthermore, this effect was more prominent in cells cultured in SF suggesting that growth factors in the serum may attenuate the effect of mutant Kras on reovirus sensitivity. Expression of the cell cycle regulator, p21 was preferentially increased upon reovirus infection in Kras mutant compared to WT cells, and in cells cultured in SF compared to SR conditions. Conclusion: Oncogenic Kras mutations increase the sensitivity of colon cancer cells to Reovirus. Clinical trials are underway testing reovirus in patients with Kras mutant metastatic colorectal cancer. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 103rd Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2012 Mar 31-Apr 4; Chicago, IL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2012;72(8 Suppl):Abstract nr 4420. doi:1538-7445.AM2012-4420

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,367
Écart entre enseignants0,331 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
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