Chromosome 6p amplification and cancer progression
Notice bibliographique
Résumé
Chromosomal imbalances represent an important mechanism in cancer progression. A clear association between DNA copy-number aberrations and prognosis has been found in a variety of tumours. Comparative genomic hybridisation studies have detected copy-number increases affecting chromosome 6p in several types of cancer. A systematic analysis of large tumour cohorts is required to identify genomic imbalances of 6p that correlate with a distinct clinical feature of disease progression. Recent findings suggest that a central part of the short arm of chromosome 6p harbours one or more oncogenes directly involved in tumour progression. Gains at 6p have been associated with advanced or metastatic disease, poor prognosis, venous invasion in bladder, colorectal, ovarian and hepatocellular carcinomas. Copy number gains of 6p DNA have been described in a series of patients who presented initially with follicle centre lymphoma, which subsequently transformed to diffuse large B cell lymphoma. Melanoma cytogenetics has consistently identified aberrations of chromosome 6, and a correlation with lower overall survival has been described. Most of the changes observed in tumours to date map to the 6p21-p23 region, which encompasses approximately half of the genes on all of chromosome 6 and one third of the number of CpG islands in this chromosome. Analyses of the genes that cluster to the commonly amplified regions of chromosome 6p have helped to identify a small number of molecular pathways that become deregulated during tumour progression in diverse tumour types. Such pathways offer promise for new treatments in the future.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,004 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».