Duplication of Chromosome 17 CEP Predicts for Anthracycline Benefit: A Meta-Analysis of 4 Trials.
Notice bibliographique
Résumé
Abstract ABSTRACT WITHDRAWN: This abstract was withdrawn by the authors prior to the start of the Symposium. Background: Current evidence for HER2/TOP2A as predictive biomarkers of anthracycline response is conflicting. An interim meta-analysis (Di Leo et al Cancer Res;69:99S SABCS2009) suggested a weak, statistically significant, association between TOP2A and anthracycline benefit. We previously showed duplication of chromosome 17 alpha satellite (CEP17) predicted sensitivity to anthracyclines independently in three trials (BR9601, NEAT and MA.5, Bartlett et al Cancer Res 69:74S/364S). We performed a retrospective meta-analysis, incorporating data from 4 trials (including the Belgium study), to test the hypothesis that CEP17 is a predictive biomarker for anthracycline benefit in order to provide a unifying hypothesis in trials for which previous biomarker data is conflicting.Methods: FISH was performed in 2 labs (Bartlett lab for BR9601/NEAT & Belgian studies & O'Malley lab for MA5). ER/PgR (IHC) etc were collected from trial Case Report Forms. BR9601/NEAT and Belgian study tumors were scored counting all cells with a minimum of one CEP17 signal/cell: in MA.5 a minimum of 2 CEP17 signals were required for cells to be scored. These methodological differences did not affect HER2/CEP17 ratios but necessitated different definitions for CEP17 duplication defined as >1.86 observed copies/cell for BR9601, NEAT and JB (Watters BCRT 2003 77:109-14) and >2.25 for MA.5 (Goetz 2004).Results: FISH was successful in 85% (2531/2975) of cases. CEP17 duplication was detected in 27.5% of tumors (BR9601=37.6%, NEAT=20.0%, MA5=40.2% & JB=28.5%) and was associated with poorer RFS & OS (HR 0.80 95%CI 0.7-0.92 p=0.011 & HR 0.79, 95%CI 0.68-9.92, p=0.018, respectively).A significant treatment*marker interaction was observed in a meta-analysis of all data (2531 cases) as univariate(p<0.005) & multivariate adjusted for treatment, grade, size, ER, nodes CEP17, CEP17*treatment & HER2 and for recurrence free (HR 1.67 95%CI 1.25-2.22, p=0.0006) & overall (1.63 95%CI 1.18-2.25, p=0.003) survival. In the two largest studies, NEAT (n=1462) and MA5 (n=622), this treatment*marker interaction (CEP17) was significant for RFS (p<0.05) in all other analyses non-significant trends for RFS & OS were seen. (Trial specific HRs with 95%CIs RFS: 1.37 (0.56-3.15), 1.77 (1.07-2.90), 1.62 (1.02-2.58) & 1.69 (0.43-6.68), OS: 1.35 (0.54-3.38), 1.64 (0.96-2.80), 1.67 (0.99-2.84) & 2.05 (0.43-9.69); BR9601, NEAT, MA5 & Belgian respectively) analyses.Conclusions: Combined meta-analysis of 4 adjuvant trials demonstrated a highly significant treatment by marker effect for CEP17 duplication as a predictor of benefit from anthracyclines for both RFS in both univariate and multivariate regression analyses. HER2 (all 4 trials) and TOP2A (NEAT/BR9601) did not show any significant interactions. CEP17 duplication may reflect either chromosomal instability or polyploidy and further analysis is warranted to explore the underlying mechanisms for this effect. CEP17 is readily assessed in ISH analysis of HER2 status and may represent a clinically useful biomarker for selection of patients likely to benefit from anthracycline containing chemotherapies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,014 | 0,018 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,003 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,009 | 0,033 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,003 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».