High light enhances the expression of low‐CO<sub>2</sub>‐inducible transcripts involved in the CO<sub>2</sub>‐concentrating mechanism in <i>Synechocystis</i> sp. PCC6803
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT The relative abundances of key gene transcripts encoding proteins involved in inducible inorganic carbon (Ci) transport in the cyanobacterium Synechocystis PCC6803 were quantified by real‐time reverse‐transcriptase‐polymerase chain reaction under conditions of varying Ci and light levels. Significant increases in CO2‐concentrating mechanism (CCM)‐related transcript abundance were observed only in cells aerated with CO2‐free air for 30 min in the light, but not in the dark, relative to illuminated cells grown at high CO2 levels (high‐Ci cells). Cells were incubated under precisely defined conditions in a cuvette attached to a mass spectrometer to allow for the measurement of photosynthetic gas exchange rates, [Ci] and [O2], in combination with quantitative analysis of transcripts. Under conditions of increasing irradiance and low [Ci], or under conditions of decreasing [Ci] at constant irradiance, the abundances of cmpA (encoding part of the BCT1 HCO3– transporter), ndhF3 (encoding subunit of high‐affinity CO2 uptake system) and sbtA (encoding Na+‐dependent HCO3– transporter) transcripts tended to increase, relative to illuminated cells grown at high‐CO2. The cmpA transcript appeared to be less responsive to decreasing [Ci] than either ndhF3 or sbtA. The induction of cmpA and ndhF3 transcripts was completely inhibited by 10 µm 3‐(3,4‐dichlorophenyl)‐1,1‐dimethylurea (DCMU) compared to untreated control cells. This inhibitor had no effect on sbtA expression. In the presence of 2,6‐dichlorobenzoquinone (DCBQ), the expression of the cmpA transcript tracked the apparent rate of O2 evolution from photosystem II closely as the irradiance was increased, reaching maximum levels of expression approximately 16‐fold higher than control cells. Under the same conditions, the ndhF3 transcript increased by two‐ to three‐fold, whereas the sbtA transcript did not respond to this treatment. The regulation of CCM induction in this strain is discussed in relation to current hypotheses on the sensing of Ci limitation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».