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Enregistrement W2033019671 · doi:10.1111/j.1365-3040.2004.01175.x

High light enhances the expression of low‐CO<sub>2</sub>‐inducible transcripts involved in the CO<sub>2</sub>‐concentrating mechanism in <i>Synechocystis</i> sp. PCC6803

2004· article· en· W2033019671 sur OpenAlexaff
Patrick J. McGinn, G. Dean Price, Murray R. Badger

Notice bibliographique

RevuePlant Cell & Environment · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePhotosynthetic Processes and Mechanisms
Établissements canadiensMount Allison University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDCMUSynechocystisCuvettePhotosynthesisMolecular biologyCyanobacteriaGene expressionBiologyChemistryMessenger RNABiophysicsGeneBiochemistryPhotosystem IIBacteriaGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT The relative abundances of key gene transcripts encoding proteins involved in inducible inorganic carbon (C i ) transport in the cyanobacterium Synechocystis PCC6803 were quantified by real‐time reverse‐transcriptase‐polymerase chain reaction under conditions of varying C i and light levels. Significant increases in CO 2 ‐concentrating mechanism (CCM)‐related transcript abundance were observed only in cells aerated with CO 2 ‐free air for 30 min in the light, but not in the dark, relative to illuminated cells grown at high CO 2 levels (high‐C i cells). Cells were incubated under precisely defined conditions in a cuvette attached to a mass spectrometer to allow for the measurement of photosynthetic gas exchange rates, [C i ] and [O 2 ], in combination with quantitative analysis of transcripts. Under conditions of increasing irradiance and low [C i ], or under conditions of decreasing [C i ] at constant irradiance, the abundances of cmpA (encoding part of the BCT1 HCO 3 – transporter), ndhF3 (encoding subunit of high‐affinity CO 2 uptake system) and sbtA (encoding Na + ‐dependent HCO 3 – transporter) transcripts tended to increase, relative to illuminated cells grown at high‐CO 2 . The cmpA transcript appeared to be less responsive to decreasing [C i ] than either ndhF3 or sbtA . The induction of cmpA and ndhF3 transcripts was completely inhibited by 10 µ m 3‐(3,4‐dichlorophenyl)‐1,1‐dimethylurea (DCMU) compared to untreated control cells. This inhibitor had no effect on sbtA expression. In the presence of 2,6‐dichlorobenzoquinone (DCBQ), the expression of the cmpA transcript tracked the apparent rate of O 2 evolution from photosystem II closely as the irradiance was increased, reaching maximum levels of expression approximately 16‐fold higher than control cells. Under the same conditions, the ndhF3 transcript increased by two‐ to three‐fold, whereas the sbtA transcript did not respond to this treatment. The regulation of CCM induction in this strain is discussed in relation to current hypotheses on the sensing of C i limitation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,978

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,189
Écart entre enseignants0,182 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations40
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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