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Enregistrement W2033056107 · doi:10.1186/1471-2199-9-15

Iron-dependent degradation of IRP2 requires its C-terminal region and IRP structural integrity

2008· article· en· W2033056107 sur OpenAlexafffund
Jian Wang, Guohua Chen, Julie Lee, Kostas Pantopoulos

Notice bibliographique

RevueBMC Molecular Biology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueIron Metabolism and Disorders
Établissements canadiensMcGill UniversityJewish General Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésUbiquitinC-terminusProtein degradationMutantAmino acidRegulatorBiologyDegradation (telecommunications)BiochemistryProteasomeCell biologyChemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Iron regulatory protein 2 (IRP2), a post-transcriptional regulator of cellular iron metabolism, undergoes iron-dependent degradation via the ubiquitin-proteasome pathway. A stretch of 73 amino acids within the N-terminal domain 1 of the protein was reported to function as an iron sensor. However, mutants lacking this fragment remain sensitive to degradation in iron-replete cells. RESULTS: To identify elements within IRP2 involved in the control of its stability, we undertook a systematic mutagenesis approach. Truncated versions of IRP2 were expressed in H1299 cells and analyzed for their response to iron. Deletion mutants lacking the entire C-terminal domain 4 (amino acids 719-963) of IRP2 remained stable following iron treatments. Moreover, the replacement of domain 4 of IRP1 with the corresponding region of IRP2 sensitized the chimerical IRP11-3/IRP24 protein to iron-dependent degradation, while the reverse manipulation gave rise to a stable chimerical IRP21-3/IRP14 protein. The deletion of just 26 or 34 C-terminal amino acids stabilized IRP2 against iron. However, the fusion of C-terminal IRP2 fragments to luciferase failed to sensitize the indicator protein for degradation in iron-loaded cells. CONCLUSION: Our data suggest that the C-terminus of IRP2 contains elements that are necessary but not sufficient for iron-dependent degradation. The functionality of these elements depends upon the overall IRP structure.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,308
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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