Peptide sequence scrambling through cyclization of b<sub>5</sub> ions
Notice bibliographique
Résumé
The CID mass spectra of the MH(+) ions and the b(5) ions derived therefrom have been determined for the hexapeptides YAAAAA, AYAAAA, AAYAAA, AAAYAA, and AAAAYA. The CID mass spectra for the b(5) ions derived from the five isomers are essentially identical and show abundant ion signals for nonsequence b ions. This result is consistent with cyclization of the b(5) ions to a cyclic pentapeptide before fragmentation; this cyclic peptide can open at various positions, leading to losses of amino acid residues that are not characteristic of the original amino acid sequence. These nonsequence b ions are also observed in the fragmentation of the MH(+) ions and increase substantially in importance with increasing collision energy. A comparison of the fragmentation of AAAYAA and Ac-AAAYAA indicates that N-acetylation eliminates the cyclization of b(5) ions and, thus, eliminates the nonsequence ions in the CID mass spectra of both b(5) and MH(+) ions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».