P3‐006: MINING THE NEURAL AND PLASMA PHOSPHOLIPIDOME TO IDENTIFY CRITICAL LIPID DETERMINANTS OF ALZHEIMER'S DISEASE CONVERSION
Notice bibliographique
Résumé
Commonly conceptualized as undulating fields of identical molecules, neuronal membranes are, in fact, made up of hundreds of chemically and molecularly diverse lipid species. Here, we asked whether impairment of phosphocholine (PC) membrane can be used to predict transition from a pre-symptomatic to symptomatic state in (1) an experimental mouse model of familial Alzheimer's Disease (AD) and (2) in a clinical pilot study of mild cognitive impairment (MCI) and sporadic AD. The PC lipidome was profiled in hippocampus, temporal cortex, plasma at 2, 4, 6, and 8 months in the TgCRND8 AD mouse model and their NonTg littermates following assessment of learning and memory impairment in the Morris Water Maze. These results were compared to clinical circulating profiles of a pilot cohort of 21 cognitively normal, 17 mild cognitive impairment (MCI) patients, and 32 AD patients. Patients were assessed using the Clinical Dementia Rating (CDR), Structured Clinical Interview for DSM-IV Disorders - Depression scale (SCID-I), Hamilton Rating Scale for Depression [HAM-D], and Mini Mental State Examination (MMSE). PCs were isolated using a modified Bligh & Dyer method adapted for efficient extraction of phosphatidylcholines, alkyacylphosphocholines, plasmenylacylphosphocholines, and acylformylglycerophosphocholines. Profiling was performed by LC-ESI-MS with in both precursor ion mode (discovery) and multiple reaction monitoring mode (quantitation). 499 unique PC lipid species were identified. In NonTg mice, PCs clearly clustered into expected patterns of “stable” critical compositions, structural species being actively mobilized to maintain these critical compositions, and bioactive signaling molecules. The abundance of 24 PC species was significantly altered in 5.5 month old TgCRND8 mice. Significant correlations between the abundance of 13 species in either the hippocampus or temporal cortex were detected that could be predicted by associated changes in the circulating lipidome. Experimental profiles were then compared to clinical profiles as part of a pilot study. Increases in 3 critical species correlated with CDR and/or MMSE scores in MCI and AD and 4 species correlated with HAM-D scores in controls. These data provide proof of principle justifying a larger clinical investigation into the capacity of the circulating phospholipidome to predict disease progression.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».