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Enregistrement W2033264410 · doi:10.1128/jvi.79.11.7087-7094.2005

Enterovirus 70 Binds to Different Glycoconjugates Containing α2,3-Linked Sialic Acid on Different Cell Lines

2005· article· en· W2033264410 sur OpenAlexafffund
M.R. Nokhbeh, Samir Hazra, D. M. Alexander, Ahmar Khan, Morgan McAllister, Erik J. Suuronen, May Griffith, Kenneth Dimock

Notice bibliographique

RevueJournal of Virology · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCytomegalovirus and herpesvirus research
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésSialic acidBiologySialidaseGlycoconjugateCell cultureReceptorN-Acetylneuraminic acidTropismVirusGlycosylationGlycoproteinVirologyMolecular biologyBiochemistryNeuraminidase

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Enterovirus 70 (EV70), the causative agent of acute hemorrhagic conjunctivitis, exhibits a restricted tropism for conjunctival and corneal cells in vivo but infects a wide spectrum of mammalian cells in culture. Previously, we demonstrated that human CD55 is a receptor for EV70 on HeLa cells but that EV70 also binds to sialic acid-containing receptors on a variety of other human cell lines. Virus recognition of sialic acid attached to underlying glycans by a particular glycosidic linkage may contribute to host range, tissue tropism, and pathogenesis. Therefore, we tested the possibility that EV70 binds to alpha2,3-linked sialic acid, like other viruses associated with ocular infections. Through the use of linkage-specific sialidases, sialyltransferases, and lectins, we show that EV70 recognizes alpha2,3-linked sialic acid on human corneal epithelial cells and on U-937 cells. Virus attachment to both cell lines is CD55 independent and sensitive to benzyl N-acetyl-alpha-D-galactosaminide, an inhibitor of O-linked glycosylation. Virus binding to corneal cells, but not U-937 cells, is inhibited by proteinase K, but not by phosphatidylinositol-specific phospholipase C treatment. These results are consistent with the idea that a major EV70 receptor on corneal epithelial cells is an O-glycosylated, non-glycosyl phosphatidylinositol-anchored membrane glycoprotein containing alpha2,3-linked sialic acid, while sialylated receptors on U-937 cells are not proteinaceous.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,326
Écart entre enseignants0,294 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations51
Publié2005
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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