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Enregistrement W2033283073 · doi:10.1242/jeb.038844

Use it or lose it? Sablefish,<i>Anoplopoma fimbria</i>, a species representing a fifth teleostean group where the βNHE associated with the red blood cell adrenergic stress response has been secondarily lost

2010· article· en· W2033283073 sur OpenAlexafffund
Jodie L. Rummer, Mani Roshan‐Moniri, Shannon K. Balfry, Colin J. Brauner

Notice bibliographique

RevueJournal of Experimental Biology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiquePhysiological and biochemical adaptations
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of British Columbia
Mots-clésBiologyRed blood cellAcidosisInternal medicineEndocrinologyChemistryBiochemistryMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Like most teleosts, sablefish (Anoplopoma fimbria Pallas 1814) blood exhibits a moderate Root effect (~35% maximal desaturation), where a reduction in blood pH dramatically reduces O(2) carrying capacity, a mechanism important for oxygenating the eye and filling the swim bladder (SB) in teleosts. Although sablefish lack a SB, we observed a well-defined choroid rete at the eye. The adrenergically mediated cell swelling typically associated with a functional red blood cell (RBC) beta-adrenergic Na(+)/H(+) exchanger (betaNHE), which would normally protect RBC pH, and thus O(2) transport, during a generalized acidosis, was not observed in sablefish blood. Neither isoproterenol (a beta-agonist) nor 8-bromo cAMP could elicit this response. Furthermore, RBC osmotic shrinkage, known to stimulate NHEs in general and betaNHE in other teleosts such as trout and flounder, resulted in no significant regulatory volume increase (RVI), further supporting the absence of a functional RBC betaNHE. The onset of the Root effect occurs at a much lower RBC pH (6.83-6.92) than in other teleosts, and thus RBC betaNHE may not be required to protect O(2) transport during a generalized acidosis in vivo. Phylogenetically, sablefish may represent a fifth group of teleosts exhibiting a secondary reduction or loss of betaNHE activity. However, sablefish have not lost the choroid rete at the eye (unlike in the other four groups), which may still function with the Root effect to oxygenate the retina, but the low pH onset of the Root effect may ensure haemoglobin (Hb)-O(2) binding is not compromised at the respiratory surface during a general acidosis in the absence of RBC betaNHE. The sablefish may represent an anomaly within the framework of Root effect evolution, in that they possess a moderate Root effect and a choroid rete at the eye, but lack the RBC betaNHE and the SB system.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,017

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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