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Enregistrement W2033355598 · doi:10.1021/bi0255625

Structure−Function Analysis of Human Triacylglycerol Hydrolase by Site-Directed Mutagenesis:  Identification of the Catalytic Triad and a Glycosylation Site

2002· article· en· W2033355598 sur OpenAlexaff
Mustafa Alam, Dennis E. Vance, Richard Lehner

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatic function and diabetes
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiochemistryCatalytic triadSite-directed mutagenesisActive siteGlycosylationMutagenesisHydrolaseEnzymeEndoplasmic reticulumHistidineSignal peptideBiologyMutantChemistrySerineLipasePeptide sequence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Triacylglycerol hydrolase is a microsomal enzyme that hydrolyzes stored cytoplasmic triacylglycerol in the liver and participates in the lipolysis/re-esterification cycle during the assembly of very-low-density lipoproteins. The structure-activity relationship of the enzyme was investigated by site-directed mutagenesis and heterologous expression. Expression of human TGH in Escherichia coli yields a protein without enzymatic activity, which suggests that posttranslational processing is necessary for the catalytic activity. Expression in baculovirus-infected Sf-9 cells resulted in correct processing of the N-terminal signal sequence and yielded a catalytically active enzyme. A putative catalytic triad consisting of a nucleophilic serine (S221), glutamic acid (E354), and histidine (H468) was identified. Site-directed mutagenesis of the residues (S221A, E354A, and H468A) yielded a catalytically inactive enzyme. CD spectra of purified mutant proteins were very similar to that of the wild-type enzyme, which suggests that the mutations did not affect folding. Human TGH was glycosylated in the insect cells. Mutagenesis of the putative N-glycosylation site (N79A) yielded an active nonglycosylated enzyme. Deletion of the putative C-terminal endoplasmic reticulum retrieval signal (HIEL) did not result in secretion of the mutant protein. A model of human TGH structure suggested a lipase alpha/beta hydrolase fold with a buried active site and two disulfide bridges (C87-C116 and C274-C285).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,045
Score d'incertitude au seuil0,367

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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