MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2033355598 · doi:10.1021/bi0255625

Structure−Function Analysis of Human Triacylglycerol Hydrolase by Site-Directed Mutagenesis:  Identification of the Catalytic Triad and a Glycosylation Site

2002· article· en· W2033355598 sur OpenAlexaff
Mustafa Alam, Dennis E. Vance, Richard Lehner

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatic function and diabetes
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiochemistryCatalytic triadSite-directed mutagenesisActive siteGlycosylationMutagenesisHydrolaseEnzymeEndoplasmic reticulumHistidineSignal peptideBiologyMutantChemistrySerineLipasePeptide sequence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Triacylglycerol hydrolase is a microsomal enzyme that hydrolyzes stored cytoplasmic triacylglycerol in the liver and participates in the lipolysis/re-esterification cycle during the assembly of very-low-density lipoproteins. The structure-activity relationship of the enzyme was investigated by site-directed mutagenesis and heterologous expression. Expression of human TGH in Escherichia coli yields a protein without enzymatic activity, which suggests that posttranslational processing is necessary for the catalytic activity. Expression in baculovirus-infected Sf-9 cells resulted in correct processing of the N-terminal signal sequence and yielded a catalytically active enzyme. A putative catalytic triad consisting of a nucleophilic serine (S221), glutamic acid (E354), and histidine (H468) was identified. Site-directed mutagenesis of the residues (S221A, E354A, and H468A) yielded a catalytically inactive enzyme. CD spectra of purified mutant proteins were very similar to that of the wild-type enzyme, which suggests that the mutations did not affect folding. Human TGH was glycosylated in the insect cells. Mutagenesis of the putative N-glycosylation site (N79A) yielded an active nonglycosylated enzyme. Deletion of the putative C-terminal endoplasmic reticulum retrieval signal (HIEL) did not result in secretion of the mutant protein. A model of human TGH structure suggested a lipase alpha/beta hydrolase fold with a buried active site and two disulfide bridges (C87-C116 and C274-C285).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBiochemistryMême sujetPancreatic function and diabetesTravaux en français237 207