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Enregistrement W2033383932 · doi:10.1021/jm061200+

Structure-Based Design, Synthesis, and A-Site rRNA Cocrystal Complexes of Functionally Novel Aminoglycoside Antibiotics:  C2‘ ‘ Ether Analogues of Paromomycin

2007· article· en· W2033383932 sur OpenAlexaff
Stephen Hanessian, Janek Szychowski, Susanta Adhikari, Guillermo Vasquez, Kandasamy Pachamuthu, Eric E. Swayze, Michael T. Migawa, Ray Ranken, Boris François, Julia Wirmer‐Bartoschek, Jiro Kondo, Éric Westhof

Notice bibliographique

RevueJournal of Medicinal Chemistry · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA and protein synthesis mechanisms
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésParomomycinAminoglycosideChemistryNeomycinStereochemistryAntibioticsKanamycinMoietyEtherCocrystalRibosomal RNABiochemistryPharmacologyBiologyOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A series of 2"-O-substituted ether analogues of paromomycin were prepared based on new site-selective functionalizations. X-ray cocrystal complexes of several such analogues revealed a new mode of binding in the A-site rRNA, whereby rings I and II adopted the familiar orientation and position previously observed with paromomycin, but rings III and IV were oriented differently. With few exceptions, all of the new analogues showed potent inhibitory activity equal or better than paromomycin against a sensitive strain of S. aureus. Single digit microM MIC values were obtained against E. coli, with some of the ether appendages containing polar or basic end groups. Two analogues showed excellent survival rate in a mouse septicemia protection assay. Preliminary histopathological analysis of the kidney showed no overt signs of toxicity, while controls with neomycin and kanamycin were toxic at lower doses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,059
Score d'incertitude au seuil0,666

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations51
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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