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Enregistrement W2033605022 · doi:10.1097/pas.0b013e31828c63ed

Histotype-Genotype Correlation in 36 High-grade Endometrial Carcinomas

2013· article· en· W2033605022 sur OpenAlexafffund
Lien Hoang, Melissa K. McConechy, Martin Köbel, Guangming Han, Marjan Rouzbahman, Ben Davidson, Julie Irving, Rola H. Ali, Sam Leung, Jessica N. McAlpine, Esther Oliva, Marisa R. Nucci, Robert A. Soslow, David G. Huntsman, C. Blake Gilks, Cheng‐Han Lee

Notice bibliographique

RevueThe American Journal of Surgical Pathology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEndometrial and Cervical Cancer Treatments
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaUniversity of TorontoUniversity of CalgaryVancouver General Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésConcordanceSerous fluidGenotypePathologyMedicinePTENSerous carcinomaHematopathologyClear cellCarcinomaBiologyInternal medicineCancerCytogeneticsOvarian cancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Endometrioid, serous, and clear cell carcinomas are the major types of endometrial carcinoma. Histologic distinction between these different tumor types can be difficult in high-grade cases, in which significant interobserver diagnostic disagreement exists. Endometrioid and clear cell carcinomas frequently harbor ARID1A and/or PTEN mutations. Serous carcinoma acquires TP53 mutations/inactivation at onset, with a significant subset harboring an additional mutation in PPP2R1A. This study examines the correlation between tumor histotype and genotype in 36 previously genotyped high-grade endometrial carcinomas. This included 23 endometrioid/clear cell genotype and 13 serous genotype tumors. Eight subspecialty pathologists reviewed representative online slides and rendered diagnoses before and after receiving p53, p16, and estrogen receptor immunostaining results. κ statistics for histotype-genotype concordance were calculated. The average κ values for histotype-genotype concordance was 0.55 (range, 0.30 to 0.67) on the basis of morphologic evaluation alone and it improved to 0.68 (range, 0.54 to 0.81) after immunophenotype consideration (P<0.001). Genotype-incompatible diagnoses were rendered by at least 2 pathologists in 12 of 36 cases (33%) (3 cases by 2/8 pathologists, 2 by 3/8, 2 by 4/8, 3 by 6/8, 1 by 7/8, and 1 case by 8/8 pathologists). Six of the 12 were endometrioid/clear cell genotype tumors, and the other 6 were serous genotype tumors. The histopathologic features associated with histotype-genotype-discordant cases were reviewed, and specific diagnostic recommendations were made to improve concordance. This study found that although the majority of morphologic diagnoses are genotype concordant, genotype-incompatible diagnoses are made in a significant subset of cases. Judicious use and interpretation of p53 immunohistochemistry in selected scenarios can improve histotype-genotype concordance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,498
Score d'incertitude au seuil0,609

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations141
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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