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Enregistrement W2033633688 · doi:10.1046/j.1524-475x.2002.10406.x

Molecular and cell biology of porcine HSP47 during wound healing: complete cDNA sequence and regulation of gene expression

2002· article· en· W2033633688 sur OpenAlexaff
Jian Fei Wang, Robert J. Winkfein, William M. Kulyk, J. Barry Wright, David A. Hart

Notice bibliographique

RevueWound Repair and Regeneration · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHeat shock proteins research
Établissements canadiensFort Saskatchewan Community HospitalUniversity of SaskatchewanUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésComplementary DNABiologySignal peptideEndoplasmic reticulumMolecular biologyGenecDNA libraryRapid amplification of cDNA endsPeptide sequenceWound healingGene expressionCell biologyBiochemistryGeneticsMolecular cloning

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Heat shock protein (HSP) 47 is a major stress-inducible protein that is localized to the endoplasmic reticulum of avian and mammalian cells and is thought to act as a molecular chaperone specific for the processing of procollagen. However, limited information is available regarding the regulation of HSP47 during wound healing. Using a polymerase chain reaction strategy, screening of a cDNA library, and RACE-polymerase chain reaction approaches, the sequence of a full-length porcine HSP47 cDNA has been identified. The cDNA contained 2096 bp that encodes for an 18 amino acid signal peptide and a mature protein coding region consisting of 401 amino acid residues. It also included 108 bp of the 5' noncoding region and a 731-bp 3' noncoding region. The deduced amino acid is 83% identical to chicken, 87% identical to mouse, 88% identical to rat, and 91% identical to human HSP47. It also shares between 26% and 30% identity with different members of the serine protease inhibitor superfamily. The protein contains a RDEL endoplasmic reticulum retention signal, and two potential glycosylation sites. All of these features are characteristic of HSP47 in higher vertebrates. Heat shock treatment of porcine fibroblasts led to up-regulation of HSP47 at both the transcriptional and translational levels. HSP47 protein levels were also up-regulated during skin wound healing in a pig model. Moreover, a higher molecular weight complex at approximately 140 Kda containing HSP47 was detected at the stage of healing that was coincident with the maximal transcriptional expression of HSP47 during wound healing in this animal model. Further investigation of how HSP47 is regulated during normal and abnormal skin wound healing may lead to new therapeutic approaches to improve the healing process.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,387

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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