Using environmental niche models to test the ‘everything is everywhere’ hypothesis for <i>Badhamia</i>
Notice bibliographique
Résumé
It is often discussed whether the biogeography of free-living protists is better explained by the 'everything is everywhere'(EiE) hypothesis, which postulates that only ecology drives their distribution, or by the alternative hypothesis of 'moderate endemicity' in which geographic barriers can limit their dispersal. To formally test this, it would be necessary not only to find organisms restricted to a geographical area but also to check for their presence in any other place with a similar ecology. We propose the use of environmental niche models to generate and test null EiE distributions. Here we have analysed the distribution of 18S rDNA variants (ribotypes) of the myxomycete Badhamia melanospora (belonging to the protozoan phylum Amoebozoa) using 125 specimens from 91 localities. Two geographically structured groups of ribotypes congruent with slight morphological differences in the spores can be distinguished. One group comprises all populations from Argentina and Chile, and the other is formed by populations from North America together with human-introduced populations from other parts of the world. Environmental climatic niche models constructed separately for the two groups have significant differences, but show several overlapping areas. However, only specimens from one group were found in an intensively surveyed area in South America where both niche models overlap. It can be concluded that everything is not everywhere for B. melanospora. This taxon constitutes a complex formed by at least two cryptic species that probably diverged allopatrically in North and South America.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,005 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».