On the evolutionary significance and metal-binding characteristics of a monolobal transferrin from <i>Ciona intestinalis</i>
Notice bibliographique
Résumé
Transferrins are a family of proteins that bind and transport Fe(III). Modern transferrins are typically bilobal and are believed to have evolved from an ancient gene duplication of a monolobal form. A novel monolobal transferrin, nicatransferrin (nicaTf), was identified in the primitive ascidian species Ciona intestinalis that possesses the characteristic features of the proposed ancestral Tf protein. In this work, nicaTf was expressed in Pichia pastoris. Extensive solution studies were performed on nicaTf, including UV-vis, fluorescence, CD, EPR and NMR spectroscopies, and electrospray time-of-flight mass spectrometry. The expressed protein is nonglycosylated, unlike the protein isolated from the organism. This property does not affect its ability to bind Fe(III). However, Fe(III)-bound nicaTf displays important spectral differences from other Fe(III)-bound transferrins, which are likely the consequence of differences in metal coordination. Coordination differences could also account for the weaker affinity of nicaTf for Fe(III) (log K = 18.5) compared with bilobal human serum transferrin (HsTf) (log K = 22.5 and 21.4). The Fe-nicaTf complex is not labile, as indicated by slow metal removal kinetics by the high-affinity chelator tiron at pH 7.4. The protein alternatively binds up to one equivalent of Ti(IV) or V(V), which suggests that it may transport nonferric metals. These solution studies provide insight into the structure and function of the primitive monolobal transferrin of C. intestinalis for comparison with higher order bilobal transferrins. They suggest that a major advantage for the evolution of modern transferrins, dominantly of bilobal form, is stronger Fe(III) affinity because of cooperativity.
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
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Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».