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Enregistrement W2033730850 · doi:10.1039/c0an00438c

Enzymatically modified peptide surfaces: towards general electrochemical sensor platform for protein kinase catalyzed phosphorylations

2010· article· en· W2033730850 sur OpenAlexafffund
Sanela Martić, Mahmoud Labib, Heinz‐Bernhard Kraatz

Notice bibliographique

RevueThe Analyst · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesOntario Ministry of Research and Innovation
Mots-clésChemistryCyclic voltammetryKinaseDielectric spectroscopySubstrate-level phosphorylationCyclin-dependent kinase 2PeptideSubstrate (aquarium)PhosphorylationProtein kinase ABiochemistryElectrochemistryElectrodeBiologyPhysical chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We hereby present an electrochemical approach for monitoring the three protein kinases sarcoma-related kinase (Src), extracellular signal-regulated kinase 1 (Erk1), and cyclin A-dependent kinase 2 (CDK2/cyclin A). The electrochemical sensor is based on the ability of kinases to transfer a redox-labeled phosphoryl group to surface-bound peptides that are highly specific substrates for the particular protein kinase (EGIYDVP, EPLTPSG, and HHASPRK, respectively). The detection method relies on the use of 5'-γ-ferrocenoyl-ATP (Fc-ATP) as a co-substrate for peptide phosphorylation. The peptides themselves are attached to a Au substrate, which acts as the working electrode. In this process a Fc-phosphoryl group is transferred to the peptide and the presence of the redox active Fc group is detected electrochemically. All peptide films were fully characterized by cyclic voltammetry (CV), square wave voltammetry (SWV), and electrochemical impedance spectroscopy (EIS). Particular attention was given to the electron transfer rates, k(ET), in peptide films after Fc-phosphorylation which were found to be on the order of seconds. The slow ET kinetics is presumably a result of the negative charge on the phosphoryl group. Time-of-flight secondary ion mass spectrometry (TOF-SIMS) and X-ray photoelectron spectroscopy (XPS) experiments based on the peptide modified Au surfaces reveal significant ferrocene and phosphate group content introduced using the kinase-catalyzed phosphorylation reaction.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,580

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations40
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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