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Enregistrement W2033763396 · doi:10.1158/1538-7445.am2011-2103

Abstract 2103: Reduced Tip60 expression as a predictive biomarker for advanced melanoma and patient outcome

2011· article· en· W2033763396 sur OpenAlexaff
Guangdi Chen, Yabin Chen, Zhizhong Zhang, Magdalena Martinka, Gang Li

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMolecular Biology Techniques and Applications
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMelanomaMedicineTissue microarrayOncologyProportional hazards modelBiomarkerCancerInternal medicineSurvival analysisImmunohistochemistryCancer researchPathologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The tumor suppressor Tip60 plays a major role in transcription, DNA damage response, apoptosis and cancer development. We investigated the role of Tip60 in melanoma pathogenesis and assessed the prognostic value of Tip60 expression on melanoma patient survival. Two sets of tissue microarrays were constructed consisting of 448 cases of melanomas (201 for the training set and 247 for the validation set) and 105 cases of nevi. The TMA was assessed for Tip60 expression by immunohistochemistry. The Kaplan-Meier method was used to evaluate the patient survival, and univariate and multivariate Cox regression models were performed to estimate the harzard ratios (HR) at five-year follow-up. We found that Tip60 expression was significantly reduced in metastatic melanoma compared to normal nevi (P = 0.045), dysplastic nevi (P = 0.047) and primary melanoma (P = 0.001). Tip60 expression correlated with AJCC stages (I-II vs III-IV, P = 0.001) and tumor thickness (≤4.00 vs. >4.00 mm, P = 0.037). Reduced Tip60 expression was associated with a poor five-year disease-specific survival in primary melanoma (P = 0.016) and metastatic melanoma patients (P = 0.027). Furthermore, Cox regression analyses indicated that Tip60 expression was an independent prognostic marker for primary (P = 0.002) and metastatic melanomas (P = 0.035). In conclusion, reduced Tip60 expression is significantly associated with thick primary melanoma and metastatic melanoma, as well as poor patient prognosis, suggesting that Tip60 may serve as a potential biomarker for advanced melanoma and patient outcome. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 102nd Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2011 Apr 2-6; Orlando, FL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2011;71(8 Suppl):Abstract nr 2103. doi:10.1158/1538-7445.AM2011-2103

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,080
Tête enseignante GPT0,416
Écart entre enseignants0,337 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2011
Routes d'admission1
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