Abstract 2103: Reduced Tip60 expression as a predictive biomarker for advanced melanoma and patient outcome
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The tumor suppressor Tip60 plays a major role in transcription, DNA damage response, apoptosis and cancer development. We investigated the role of Tip60 in melanoma pathogenesis and assessed the prognostic value of Tip60 expression on melanoma patient survival. Two sets of tissue microarrays were constructed consisting of 448 cases of melanomas (201 for the training set and 247 for the validation set) and 105 cases of nevi. The TMA was assessed for Tip60 expression by immunohistochemistry. The Kaplan-Meier method was used to evaluate the patient survival, and univariate and multivariate Cox regression models were performed to estimate the harzard ratios (HR) at five-year follow-up. We found that Tip60 expression was significantly reduced in metastatic melanoma compared to normal nevi (P = 0.045), dysplastic nevi (P = 0.047) and primary melanoma (P = 0.001). Tip60 expression correlated with AJCC stages (I-II vs III-IV, P = 0.001) and tumor thickness (≤4.00 vs. >4.00 mm, P = 0.037). Reduced Tip60 expression was associated with a poor five-year disease-specific survival in primary melanoma (P = 0.016) and metastatic melanoma patients (P = 0.027). Furthermore, Cox regression analyses indicated that Tip60 expression was an independent prognostic marker for primary (P = 0.002) and metastatic melanomas (P = 0.035). In conclusion, reduced Tip60 expression is significantly associated with thick primary melanoma and metastatic melanoma, as well as poor patient prognosis, suggesting that Tip60 may serve as a potential biomarker for advanced melanoma and patient outcome. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 102nd Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2011 Apr 2-6; Orlando, FL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2011;71(8 Suppl):Abstract nr 2103. doi:10.1158/1538-7445.AM2011-2103
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».