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Enregistrement W2033812623 · doi:10.1139/b09-032

Molecular cloning of an aldehyde dehydrogenase implicated in artemisinin biosynthesis in <i>Artemisia annua</i>This paper is one of a selection of papers published in a Special Issue from the National Research Council of Canada – Plant Biotechnology Institute.

2009· article· en· W2033812623 sur OpenAlexaffvenueabout
Keat H. Teoh, Devin R. Polichuk, Darwin W. Reed, Patrick S. Covello

Notice bibliographique

RevueBotany · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant biochemistry and biosynthesis
Établissements canadiensPlant Biotechnology Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésArtemisia annuaArtemisininAldehyde dehydrogenaseBiologyBiochemistryBiosynthesisALDH2EnzymeGeneComplementary DNAPlasmodium falciparum

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Limitations in the supply of the antimalarial compound artemisinin from Artemisia annua L. have led to an interest in understanding its biosynthesis and enhancing its production. Recent biochemical and molecular genetic data have implicated dihydroartemisinic aldehyde as a precursor to the corresponding acid, which is then converted to artemisinin. Thus, it is important to understand the enzyme or enzymes involved in dihydroartemisinic aldehyde oxidation. Given its activity on artemisinic aldehyde, the cytochrome P450 CYP71AV1 was investigated for its ability to oxidize dihydroartemisinic aldehyde. However, no net activity was detected. In a search for alternative enzymes that could catalyze the oxidation, an expressed sequence tag (EST) collection from A. annua was investigated for relevant cDNAs. This led to the isolation of a full-length cDNA encoding an aldehyde dehydrogenase homologue, named Aldh1, which is highly expressed in trichomes. Expression of the cDNA in E. coli and characterization of the purified recombinant enzyme revealed that the gene product catalyses the NAD(P)-dependent oxidation of the putative artemisinin precursors, artemisinic and dihydroartemsinic aldehydes, and a limited range of other aldehydes. The observed enzyme activity of Aldh1 and the expression pattern of the corresponding gene suggest a role in artemisinin biosynthesis in the glandular secretory trichomes of A. annua.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations257
Publié2009
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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