MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2033828678 · doi:10.1007/s13213-012-0425-8

Culturable bacterial pool from aged petroleum-contaminated soil: identification of oil-eating Bacillus strains

2012· article· en· W2033828678 sur OpenAlexaff
Giovana Granzotto, Paulo Ricardo Franco Marcelino, Aneli M. Barbosa‐Dekker, Elisete Pains Rodrigues, Maria Inês Rezende, André Luíz Martinez de Oliveira

Notice bibliographique

RevueAnnals of Microbiology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial bioremediation and biosurfactants
Établissements canadiensLakehead University
Organismes subventionnairesFundação Araucária
Mots-clésBioremediationBiology16S ribosomal RNABacillus (shape)Soil contaminationFood scienceBacteriaPopulationBiodegradationMicrobiologySoil microbiologyBacillalesContaminationBotanyEcologyBacillus subtilisGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Information gleaned from soil microbiota may provide access to new economically important species. Here, we describe the isolation, identification, and genetic diversity of high-density bacterial populations isolated from aged oil-contaminated soil. Twenty different morphotypes were identified in populations present at densities of up to 107 cells g−1 soil, encompassing seven bacterial genera based on 16S rRNA sequencing. Six isolates of the genus Bacillus were identified, three of which appear to consume oil. The genetic clusters defined by the DNA fingerprinting analysis suggest that there is a close relationship between these oil-eating Bacillus species. Isolates able to grow using crude oil as a carbon source were biochemically characterized and found to exhibit high lipolytic activity in liquid medium and to produce alkaline-stable biosurfactants. Fluorescence spectroscopy analysis of the cell-free extract from the oil-eating Bacillus sp. strain MO.04b showed an increase in the relative fluorescence intensity of low-molecular-mass aromatics concomitantly with an increase in the protein content, suggesting the transformation of aromatic hydrocarbons to the liquid phase in response to biodegradation. The approach adopted in this study suggests a low diversity of the high-density bacterial population colonizing an aged oil-contaminated soil and may prove useful in selecting bacterial isolates for bioremediation studies and biotechnological applications such as biosurfactant production.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,095
Score d'incertitude au seuil0,997

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueAnnals of MicrobiologyMême sujetMicrobial bioremediation and biosurfactantsTravaux en français237 207