The tRNA <sup>arg</sup> Gene and <i>engA</i> Are Essential Genes on the 1.7-Mb pSymB Megaplasmid of Sinorhizobium meliloti and Were Translocated Together from the Chromosome in an Ancestral Strain
Notice bibliographique
Résumé
Bacterial genomes with two (or more) chromosome-like replicons are known, and these appear to be particularly frequent in alphaproteobacteria. The genome of the N(2)-fixing alfalfa symbiont Sinorhizobium meliloti 1021 contains a 3.7-Mb chromosome and 1.4-Mb (pSymA) and 1.7-Mb (pSymB) megaplasmids. In this study, the tRNA(arg) and engA genes, located on the pSymB megaplasmid, are shown to be essential for growth. These genes could be deleted from pSymB when copies were previously integrated into the chromosome. However, in the closely related strain Sinorhizobium fredii NGR234, the tRNA(arg) and engA genes are located on the chromosome, in a 69-kb region designated the engA-tRNA(arg)-rmlC region. This region includes bacA, a gene that is important for intracellular survival during host-bacterium interactions for S. meliloti and the related alphaproteobacterium Brucella abortus. The engA-tRNA(arg)-rmlC region lies between the kdgK and dppF2 (NGR_c24410) genes on the S. fredii chromosome. Synteny analysis showed that kdgK and dppF2 orthologues are adjacent to each other on the chromosomes of 15 sequenced strains of S. meliloti and Sinorhizobium medicae, whereas the 69-kb engA-tRNA(arg)-rmlC region is present on the pSymB-equivalent megaplasmids. This and other evidence strongly suggests that the engA-tRNA(arg)-rmlC region translocated from the chromosome to the progenitor of pSymB in an ancestor common to S. meliloti and S. medicae. To our knowledge, this work represents one of the first experimental demonstrations that essential genes are present on a megaplasmid.
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Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
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