Synthesis of nucleosidic bonds using a nucleoside hydrolase in aqueous-organic media
Notice bibliographique
Résumé
The synthesis of inosine from nonactivated and nonprotected ribose and hypoxanthine was performed by enzyme-catalyzed condensation, using a nucleoside hydrolase from Crithidia fasciculata expressed in Escherichia coli with a synthetic gene. One round of directed evolution was performed in the presence of dimethylformamide, used to lower the water activity in the reaction media, leading to a double mutant (Asp54Asn, Arg137Gly). It afforded a doubling of the specificity constant for the hydrolysis of p-nitrophenol-β-d-riboside in the presence of 40% acetonitrile. In aqueous conditions, concentrations of 0.1 and 0.2 mM inosine were obtained, starting from 25 mM hypoxanthine and 2 or 3 M ribose, respectively. With 20% acetonitrile increases of 95% and 60% were observed. These conversions are very low, and the work exemplifies the difficulties encountered when trying to define conditions for hydrolase-catalyzed condensation and at the same time evolve an enzyme to perform well in these a priori unknown conditions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».