Sustained translational repression of lactate dehydrogenase 1 in <i>Toxoplasma gondii</i> bradyzoites is conferred by a small regulatory <scp>RNA</scp> hairpin
Notice bibliographique
Résumé
In response to environmental stresses, Toxoplasma gondii induces a global translational repression which allows for the remodeling of its transcriptome. While some transcripts are preferentially translated, another subset is translationally repressed and maintained in bradyzoites. Although little is known of how transcripts are targeted for sustained translational repression, the targeting probably operates through an RNA-centric mechanism relying on the recognition of cis-acting elements. In this study, we sought to determine if the targeting of transcripts through recognizable cis-acting elements could be responsible for the transcript-specific sustained translational repression displayed by Toxoplasma bradyzoites. We examined the UTRs of a translationally repressed gene, lactate dehydrogenase 1, and found a 40 nucleotide regulatory element in its 5'UTR. This element specifically induces translational repression in otherwise constitutively expressed transcripts. Mutational studies revealed that the formation of a small 16 nucleotide regulatory RNA hairpin is essential for this activity. We suggest that this hairpin may act as the nucleation site for the binding of an as yet to be identified trans-acting factor that allows for the transcript to be targeted for translational repression removal from the active translational pool. To our knowledge, this is the first report characterizing a specific cis-acting element contributing to post-transcriptional gene regulation in Toxoplasma and suggests the presence of a pathway by which the parasites can recognize, identify and specifically target transcripts for sustained translational repression under stressful conditions.
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».