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Enregistrement W2034433640 · doi:10.1158/1538-7445.am2011-4725

Abstract 4725: The 3D nuclear telomere organization of Hodgkin-cells is different between patients entering rapid remission and patients with refractory or relapsing disease

2011· article· en· W2034433640 sur OpenAlexaff
Narisorn Kongruttanachok, Bassem Sawan, Sabine Mai, Hans Knecht

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensUniversité de SherbrookeUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésABVDTelomereMedicineRefractory (planetary science)LymphomaBiopsyPathologyInternal medicineGastroenterologyChemotherapyBiologyCyclophosphamide

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Our recent study has utilized innovative 3D Q- FISH and three-dimensional (3D) imaging to define the 3D nuclear telomere organization in mono-nucleated Hodgkin (H) and multi-nucleated Reed-Sternberg (RS) cells of Hodgkin's lymphoma (HL) derived cell lines and diagnostic patient biopsies (Leukemia. 2009). These characteristics were found in both, classical EBV negative and EBV-associated, LMP1 expressing HL (Lab Invest. 2010). However, it is still unknown whether the 3D telomere profile at diagnostic biopsy is different in patients entering rapid remission after initiation of standard chemotherapy (ABVD) compared to patients with refractory or relapsing disease. In this study, we investigated by 3D telomere Q-FISH diagnostic biopsies of HL patients entering rapid complete remission and diagnostic biopsies from patients with refractory or relapsing disease. 8 diagnostic biopsies of 8 patients entering rapid remission (after 1-4 cycles of ABVD) and 8 diagnostic biopsies of 5 patients including 2 with primary refractory disease (progressing after 4-8 cycles of ABVD) and 3 cases relapsing 1-3 years after late remission (post 6 -8 cycles of ABVD) were analyzed the 3D telomeric structure by 3D Q-FISH and TeloView software (Cytometry A. 2005). We found that RS-cells of all patients from both groups showed significant increase in very short telomeres when compared to the mononuclear precursor H-cells (p<0.01). Additionally, the number of telomere aggregates was significantly higher in RS cells than in H cells in both, the rapid remission group (p<0.001) and the refractory or relapse group (p<0.01). Most importantly, all diagnostic biopsies of the relapse group contained a very high percentage of very small telomeres in both, H-cells (72.4 ± 0.1%) and RS-cells (84.6 ± 9.9%). These differences were highly significant compared the percentage of very small telomeres of the rapid remission group for both, H-cells (40.0± 0.2%) (p=0.002) and RS-cells (59.9 ± 0.2%) (p=0.008). Remarkably, the percentage of very short telomeres was even higher in H-cells of the relapse group than in RS-cells of the rapid remission group. The average number of telomere aggregates per H-cell was significantly higher in the relapse group (3.8 ± 1.9) compared to that one in the rapid remission group (1.3 ± 0.6) (p=0.0003). RS-cells in the relapse contained still more telomere aggregates compared to RS cells of the remission group (5.8 ± 2.8 versus 3.1 ± 1.1) (p=0.03). However, H-cells of the relapse group contained already more aggregates than RS cells of the remission group (p: no significant). These results indicate that the 3D nuclear telomere organization of H and RS cells in refractory or relapsing patients is different from that of patients in rapid remission. In particular, the 3D nuclear telomere profile of H-cells allows identifying aggressive disease already at diagnosis. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 102nd Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2011 Apr 2-6; Orlando, FL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2011;71(8 Suppl):Abstract nr 4725. doi:10.1158/1538-7445.AM2011-4725

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,300
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2011
Routes d'admission1
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