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Enregistrement W2034492475 · doi:10.1074/jbc.m102514200

A Conserved α-Helix at the Amino Terminus of Prosomatostatin Serves as a Sorting Signal for the Regulated Secretory Pathway

2001· article· en· W2034492475 sur OpenAlexafffund
Rania Mouchantaf, Ujendra Kumar, Traian Sulea, Yogesh Patel

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensBiotechnology Research InstituteRoyal Victoria HospitalMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésSortingSIGNAL (programming language)Cell biologySignal peptideSignal transductionChemistryBiologyPeptide sequenceBiochemistryComputer scienceGeneAlgorithm

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mammalian prosomatostatin (PSST) contains the bioactive peptides SST-14 and SST-28 at the COOH-terminal end of the molecule and a putative sorting signal in the propeptide segment for targeting the precursor to the regulated secretory pathway. The NH(2)-terminal segment of PSST consists of an amphipathic alpha-helix, which has been totally conserved throughout vertebrate evolution. We have analyzed the PSST-(3--15) region for sorting function by alanine scanning and deletional mutagenesis. Mutants created were stably expressed in AtT-20 cells. Regulated secretion was studied by analyzing basal and stimulated release of SST-14 LI and by immunocytochemistry for staining of SST-14 LI in punctate granules. Deletion of the PSST-(3--15) segment blocked regulated secretion and rerouted PSST for constitutive secretion as unprocessed precursor. Alanine scanning mutagenesis identified the region Pro(5)--Gln(12) as being important in precursor targeting, with Leu(7) and Leu(11) being critical. Molecular modeling demonstrated that these two residues are located in close proximity on a hydrophobic surface of the alpha-helix. Disruption of the alpha-helix did not impair the ability of PSST to be processed at the COOH terminus to SST-14 and SST-28. Processing, however, was shifted to the early compartments of the secretory pathway rather than storage granules and was relatively inefficient.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,286
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2001
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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