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Enregistrement W2034572103 · doi:10.1074/jbc.m203564200

Functional Characterization of pkr Gene Products Expressed in Cells from Mice with a Targeted Deletion of the N terminus or C terminus Domain of PKR

2002· article· en· W2034572103 sur OpenAlex
Dionissios Baltzis, Suiyang Li, Antonis E. Koromilas

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA regulation and disease
Établissements canadiensMcGill UniversityJewish General Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProtein kinase RBiologyExonRNA splicingEIF-2 kinaseAlternative splicingMolecular biologyRNA silencingInterferonMessenger RNARNATranscription (linguistics)Cell biologyGeneProtein kinase AKinaseRNA interferenceGeneticsMitogen-activated protein kinase kinaseCyclin-dependent kinase 2

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The interferon-inducible double-stranded RNA (dsRNA)-activated protein kinase, PKR, plays an important role in messenger (m) RNA translation by phosphorylating the alpha subunit of eukaryotic initiation factor 2. Through this capacity PKR is thought to be a mediator of the antiviral and antiproliferative actions of interferon. In addition to translational function, PKR has been implicated in many signaling pathways to gene transcription by modulating the activities of a number of transcription factors, including NF-kappa B and STATs. However, experiments with two different PKR knockout (PKR(-/-)) mouse models have failed to verify many of the biological functions attributed to PKR. In addition, results with cells from the two PKR(-/-) mice have been contradictory and confusing. Here, we show that the first PKR(-/-) mouse with deletion of exons 2 and 3, corresponding to the N terminus domain of PKR (N-PKR(-/-)), expresses a truncated protein, resulting from the translation of the exon-skipped mouse PKR (ES-mPKR) mRNA. The ES-mPKR protein is defective in dsRNA binding but remains catalytically active both in vitro and in vivo. Furthermore, we show that the second PKR(-/-) mouse with a targeted deletion of exon 12, which corresponds to the C terminus of the molecule (C-PKR(-/-)), expresses a truncated mPKR produced by alternative splicing of exon 12. Although the spliced form of mPKR (SF-mPKR) is catalytically inactive, it retains the dsRNA-binding properties of the wild type mPKR. Reverse transcription-PCRs demonstrate that SF-mPKR mRNA is expressed in several normal mouse tissues, and appears to be under developmental control during embryogenesis. Our data demonstrate that both PKR(-/-) models are incomplete knockouts, and expression of the PKR variants may account, at least in part, for the significant signaling differences between cells from the two PKR(-/-) mice.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,073
Score d'incertitude au seuil0,255

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,197
Écart entre enseignants0,183 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle