Genetic analysis of patients with the Saethre‐Chotzen phenotype
Notice bibliographique
Résumé
Saethre-Chotzen syndrome is a common craniosynostosis syndrome characterized by craniofacial and limb anomalies. Intragenic mutations of the TWIST gene within 7p21 have been identified as a cause of this disorder. There is phenotypic overlap with other craniosynostosis syndromes, and intragenic mutations in FGFR2 (fibroblast growth factor receptor 2) and FGFR3 (fibroblast growth factor receptor 3) have been demonstrated in the other conditions. Furthermore, complete gene deletions of TWIST have also been found in a significant proportion of patients with Saethre-Chotzen syndrome. We investigated 11 patients clinically identified as having the Saethre-Chotzen phenotype and 4 patients with craniosynostosis but without a clear diagnosis. Of the patients with the Saethre-Chotzen phenotype, four were found to carry the FGFR3 P250R mutation, three were found to be heterozygous for three different novel mutations in the coding region of TWIST, and two were found to have a deletion of one copy of the entire TWIST gene. Developmental delay was a distinguishing feature of the patients with deletions, compared to patients with intragenic mutations of TWIST, in agreement with the results of Johnson et al. [1998: Am J Hum Genet 63:1282-1293]. No mutations were found for the four patients with craniosynostosis without a clear diagnosis. Therefore, 9 of our 11 patients (82%) with the Saethre-Chotzen phenotype had detectable genetic changes in FGFR3 or TWIST. We propose that initial screening for the FGFR3 P250R mutation, followed by sequencing of TWIST and then fluorescence in situ hybridization (FISH) for deletion detection of TWIST, is sufficient to detect mutations in > 80% of patients with the Saethre-Chotzen phenotype.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».