<i>Pseudomonas aeruginosa</i>B-band lipopolysaccharide genes<i>wbpA</i>and<i>wbpI</i>and their<i>Escherichia coli</i>homologues<i>wecC</i>and<i>wecB</i>are not functionally interchangeable
Notice bibliographique
Résumé
The O antigen unit of Pseudomonas aeruginosa serotype O5 is a complex trisaccharide containing 2-acetamido-3-acetiminido-2, 3-dideoxy-beta-D-mannuronic acid, 2-acetimido-3-acetimido-2, 3-dideoxy-beta-D-mannuronic acid, and 2-acetimido-2, 6-deoxy-beta-D-galactosamine. Specific knockout mutations in the putative UDP-D-N-acetylglucosamine (UDP-D-GlcNAc) epimerase gene, wbpI, or the putative UDP-D-N-acetylmannosamine dehydrogenase gene, wbpA, resulted in strains that no longer produced B-band lipopolysaccharide, confirming the essential roles of these genes in B-band O antigen synthesis. Despite approximately 50% similarity of wbpI and wbpA to the Escherichia coli genes wecB (rffE) and wecC (rffD) involved in enterobacterial common antigen synthesis, cross-complementation experiments were not successful. These results imply that the P. aeruginosa UDP-D-GlcNAc precursor may be di-N-acetylated prior to further modification, preventing the E. coli enzymes from recognizing it as a substrate.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».