Molecular characterization of the cervical and systemic B-cell repertoire
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Notice bibliographique
Résumé
The cervical mucosa of women who are highly exposed to HIV-1, yet remain persistently seronegative (HEPS), presents a unique opportunity to study the dynamics of an immune compartment potentially capable of preventing HIV-1 infection. Herein, we provide a detailed characterization of the immunoglobulin repertoire of cervical and systemic B cells from one such HEPS individual from Nairobi, Kenya. Analysis was done on 512 VH sequences that were RT-PCR amplified from B cells in a paired sample from the cervix and peripheral blood. The VH3 and DH repertoire of class switched cervical B cells differs significantly from that of systemic B cells indicating that the cervical environment affects local B cell populations and hence VH gene expression. Six networks of clonally related, heavily mutated B cells were identified that spanned the systemic and cervical B cell compartments. Analysis of somatic mutations suggests this is likely the result of systemic, class switched B cells homing to the cervical mucosa. Multiple networks of somatically mutated V-gene sequences, unique to the cervical mucosa, were also identified. This supports the notion that site specific responses occur and have unique regulation of tolerance and recruitment into local memory or blast B cell compartments. We conclude that while the nature of the cervical environment shapes the local B cell repertoire, the infusion of post germinal center B cells to the human cervix is a common occurrence, and represents a means by which systemic immunization could provide the local antibodies necessary to prevent HIV-1 at the site of initial contact.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle