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Enregistrement W2034834217 · doi:10.4161/mabs.3.2.14858

Molecular characterization of the cervical and systemic B-cell repertoire

2011· article· en· W2034834217 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevuemAbs · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensBurnaby HospitalSimon Fraser UniversityUniversity of ManitobaManitoba Beekeepers' Association
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCanada Research ChairsPublic Health AgencyBill and Melinda Gates Foundation
Mots-clésGerminal centerB cellBiologyAntibodyImmunoglobulin class switchingMemory B cellImmune systemImmunologyRepertoireGeneNaive B cellGeneticsT cellAntigen-presenting cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The cervical mucosa of women who are highly exposed to HIV-1, yet remain persistently seronegative (HEPS), presents a unique opportunity to study the dynamics of an immune compartment potentially capable of preventing HIV-1 infection. Herein, we provide a detailed characterization of the immunoglobulin repertoire of cervical and systemic B cells from one such HEPS individual from Nairobi, Kenya. Analysis was done on 512 VH sequences that were RT-PCR amplified from B cells in a paired sample from the cervix and peripheral blood. The VH3 and DH repertoire of class switched cervical B cells differs significantly from that of systemic B cells indicating that the cervical environment affects local B cell populations and hence VH gene expression. Six networks of clonally related, heavily mutated B cells were identified that spanned the systemic and cervical B cell compartments. Analysis of somatic mutations suggests this is likely the result of systemic, class switched B cells homing to the cervical mucosa. Multiple networks of somatically mutated V-gene sequences, unique to the cervical mucosa, were also identified. This supports the notion that site specific responses occur and have unique regulation of tolerance and recruitment into local memory or blast B cell compartments. We conclude that while the nature of the cervical environment shapes the local B cell repertoire, the infusion of post germinal center B cells to the human cervix is a common occurrence, and represents a means by which systemic immunization could provide the local antibodies necessary to prevent HIV-1 at the site of initial contact.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,119
Score d'incertitude au seuil0,163

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,200
Écart entre enseignants0,189 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle