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Enregistrement W2034855929 · doi:10.1371/journal.pone.0071794

Phosphorylation Status of 72 kDa MMP-2 Determines Its Structure and Activity in Response to Peroxynitrite

2013· article· en· W2034855929 sur OpenAlexafffund
Anna L. Jacob‐Ferreira, Márcia Y. Kondo, Pravas Kumar Baral, Michael N.G. James, Andrew Holt, Xiaohu Fan, Richard Schulz

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtease and Inhibitor Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchAlberta Innovates
Mots-clésDephosphorylationPeroxynitriteBiochemistryChemistryPhosphorylationProteolysisPhosphataseCysteineGlutathioneSerineMatrix metalloproteinasePeptideCircular dichroismEnzymeSuperoxide

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Matrix metalloproteinase-2 (MMP-2) is a key intra- and extra-cellular protease which contributes to several oxidative stress related pathologies. A molecular understanding of 72 kDa MMP-2 activity, directly mediated by S-glutathiolation of its cysteine residues in the presence of peroxynitrite (ONOO(-)) and by phosphorylation of its serine and threonine residues, is essential to develop new generation inhibitors of intracellular MMP-2. Within its propeptide and collagen binding domains there is an interesting juxtaposition of predicted phosphorylation sites with nearby cysteine residues which form disulfide bonds. However, the combined effect of these two post-translational modifications on MMP-2 activity has not been studied. The activity of human recombinant 72 kDa MMP-2 (hrMMP-2) following in vitro treatments was measured by troponin I proteolysis assay and a kinetic activity assay using a fluorogenic peptide substrate. ONOO(-) treatment in the presence of 30 µM glutathione resulted in concentration-dependent changes in MMP-2 activity, with 0.1-1 µM increasing up to twofold and 100 µM attenuating its activity. Dephosphorylation of MMP-2 with alkaline phosphatase markedly increased its activity by sevenfold, either with or without ONOO(-). Dephosphorylation of MMP-2 also affected the conformational structure of the enzyme as revealed by circular dichroism studies, suggesting an increase in the proportion of α-helices and a decrease in β-strands compared to the phosphorylated form of MMP-2. These results suggest that ONOO(-) activation (at low µM) and inactivation (at high µM) of 72 kDa MMP-2, in the presence or absence of glutathione, is also influenced by its phosphorylation status. These insights into the role of post-translational modifications in the structure and activity of 72 kDa MMP-2 will aid in the development of inhibitors specifically targeting intracellular MMP-2.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations52
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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