MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2034872994 · doi:10.1042/bj20081424

Direct interaction of a small-molecule modulator with G551D-CFTR, a cystic fibrosis-causing mutation associated with severe disease

2008· article· en· W2034872994 sur OpenAlexaff
Stan Pasyk, Canhui Li, Mohabir Ramjeesingh, Christine E. Bear

Notice bibliographique

RevueBiochemical Journal · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCystic Fibrosis Research Advances
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCystic fibrosis transmembrane conductance regulatorChloride channelMutantGatingCell biologyMutationChemistryPhosphorylationCystic fibrosisMissense mutationCyclic nucleotide-binding domainBiochemistryBiologyBiophysicsPeptide sequenceGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

CF (cystic fibrosis) is caused by mutations in CFTR (CF transmembrane conductance regulator), which cause its mistrafficking and/or dysfunction as a regulated chloride channel on the apical surface of epithelia. CFTR is a member of the ABC (ATP-binding-cassette) superfamily of membrane proteins and a disease-causing missense mutation within the ABC signature sequence; G551D-CFTR exhibits defective phosphorylation and ATP-dependent channel gating. Studies of the purified and reconstituted G551D-CFTR protein revealed that faulty gating is associated with defective ATP binding and ATPase activity, reflecting the key role of G551 in these functions. Recently, high-throughput screens of chemical libraries led to identification of modulators that enhance channel activity of G551D-CFTR. However, the molecular target(s) for these modulators and their mechanism of action remain unclear. In the present study, we evaluated the mechanism of action of one small-molecule modulator, VRT-532, identified as a specific modulator of CF-causing mutants. First, we confirmed that VRT-532 causes a significant increase in channel activity of G551D-CFTR using a novel assay of CFTR function in inside-out membrane vesicles. Biochemical studies of purified and reconstituted G551D-CFTR revealed that potentiation of the ATPase activity of VRT-532 is mediated by enhancing the affinity of the mutant for ATP. Interestingly, VRT-532 did not affect the ATPase activity of the Wt (wild-type) CFTR, supporting the idea that this compound corrects the specific molecular defect in this mutant. To summarize, these studies provide direct evidence that this compound binds to G551D-CFTR to rescue its specific defect in ATP binding and hydrolysis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBiochemical JournalMême sujetCystic Fibrosis Research AdvancesTravaux en français237 207