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Enregistrement W2034879954 · doi:10.1096/fj.04-1982fje

Fluorescent dyes alter intracellular targeting and function of cell‐penetrating tetrapeptides

2004· article· en· W2034879954 sur OpenAlexaff
Hazel H. Szeto, Peter W. Schiller, Kesheng Zhao, Guoxiong Luo

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Interference and Gene Delivery
Établissements canadiensMontreal Clinical Research Institute
Organismes subventionnairesNational Institute on Drug Abuse
Mots-clésTetrapeptideFluorescenceChemistryBiophysicsCytoplasmPeptideMitochondrionBiochemistryRhodamineOligopeptideIntracellularMolecular biologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Fluorescent labels are commonly used to investigate the mechanisms of cellular uptake and intracellular distribution of cell-penetrating peptides. However, labels such as fluorescein and rhodamine are relatively large and very lipophilic and may significantly alter physicochemical properties of small peptides. To minimize the impact of the fluorescent probe on a tetrapeptide, we substituted one of the amino acids (Lys4) in a tetrapeptide ([Dmt1]DALDA, Dmt-D-Arg-Phe-Lys-NH2 where Dmt = 2',6'-dimethyltyrosine) with two different fluorescent amino acids (beta-dansyl-L-alpha,beta-diaminopropionic acid (dnsDap4) or beta-anthraniloyl-L-alpha,beta-diaminopropionic acid (atnDap4)). Initial studies with confocal laser scanning microscopy (CLSM) showed very different localization patterns for the two fluorescent analogs, with [Dmt1,atnDap4]DALDA showing mitochondrial localization and [Dmt1,dnsDap4]DALDA showing diffuse cytoplasmic localization. Studies with isolated mouse liver mitochondria suggested that [Dmt1,dnsDap4]DALDA targeted the mitochondrial matrix resulting in mitochondrial depolarization, opening of the permeability transition pore, mitochondrial swelling, and rapid release of the peptide into the cytoplasm. In contrast, [Dmt1,atnDap4]DALDA was retained in the inner mitochondrial membrane and did not induce mitochondrial swelling. Furthermore, [Dmt1,atnDap4]DALDA protected mitochondria against Ca2+-induced swelling. Importantly, the unlabeled parent peptide [Dmt1]DALDA behaved like [Dmt1,atnDap4]DALDA and was mitoprotective. These findings suggest that experimental results obtained with fluorescent labels must be interpreted with caution, and the use of multiple fluorophores, together with confirmation using the original or radiolabeled molecule, is recommended.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,238

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations98
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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