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Enregistrement W2035001694 · doi:10.1021/bi0484724

The α Isoform of Diacylglycerol Kinase Exhibits Arachidonoyl Specificity with Alkylacylglycerol

2004· article· en· W2035001694 sur OpenAlexaff
Richard M. Epand, Angela Kam, Nadia Bridgelal, Akihiko Saiga, Matthew K. Topham

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePeroxisome Proliferator-Activated Receptors
Établissements canadiensMcMaster UniversityHealth Sciences Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDiacylglycerol kinaseGene isoformProtein kinase CKinaseCell biologyChemistryBiochemistryComputational biologyBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We compared the diacylglycerol kinase (DGK) catalyzed phosphorylation of 1-O-hexanoyl-2-oleoylglycerol (HOG) with 1-O-hexanoyl-2-arachidonoylglycerol (HAG). We assayed the activity of DGKalpha and DGKzeta using a liposomal-based assay system. Liposomal assays show that the DGKalpha and, to a lesser extent, DGKzeta preferentially act on substrates containing an arachidonoyl group when this group is incorporated into alkylacylglycerols. The activity of DGKalpha was 82 times greater with HAG compared to HOG. DGKzeta is 10 times more active in catalyzing the phosphorylation of HAG compared to HOG. Although diacylglycerols were better substrates for both DGKalpha and DGKzeta than the alkylacylglycerols, no specificity was exhibited for arachidonoyl-containing diacylglycerols. However, this specificity for HAG over HOG is modulated by the phospholipid composition of the liposome. Addition of cholesterol and/or phosphatidylethanolamine partially reduces the substrate selectivity. We also analyzed the kinetic constants for the phosphorylation of both diacylglycerol and 1-alkyl-2-acylglycerol catalyzed by the alpha, epsilon, or zeta isoforms using a soluble Triton mixed micelle system. We found that all three isoforms of DGK can phosphorylate 1-alkyl-2-acylglycerols but generally at a lower rate than for the corresponding diacylglycerol. The specificity of DGKepsilon for diacylglycerols containing an arachidonoyl group was retained when the ester group in the C-1 position is replaced with an ether linkage. In contrast, DGKalpha and, to a lesser extent, DGKzeta had greater specificity for arachidonoyl-containing 1-alkyl-2-acylglycerols than for arachidonoyl-containing diacylglycerols. This demonstrates that the acyl chain specificity is affected by the structure of the lipid headgroup.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,207
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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