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Enregistrement W2035130219 · doi:10.1002/yea.1440

The 160 <i>N</i>‐terminal residues of calnexin define a novel region supporting viability in <i>Schizosaccharomyces pombe</i>

2007· article· en· W2035130219 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueYeast · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEndoplasmic Reticulum Stress and Disease
Établissements canadiensUniversité de MontréalUniversité du Québec à Montréal
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésCalnexinBiologySchizosaccharomyces pombeMutantChaperone (clinical)Endoplasmic reticulumCell biologySecretionYeastSchizosaccharomycesProtein foldingBiochemistryCalreticulinGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Protein secretion is a complex process that can be modulated by folding factors in the endoplasmic reticulum (ER), such as calnexin, a highly-conserved molecular chaperone involved in quality control. In Schizosaccharomyces pombe, calnexin (Cnx1p) is essential for cell viability. The calnexin/Cnx1p determinants required for viability have been mapped within the last 123 residues of its C-terminus. To better understand the role(s) of calnexin/Cnx1p in secretion, we screened for cnx1 mutants 'super-secreting' cellulase. We identified ss14_cnx1, a mutant secreting 10-fold higher levels of the glycoprotein cellulase than the wild-type strain. While cellulase did not interact with ss14_Cnx1p, the ratio of secreted activity/quantity for this enzyme was not affected, suggesting that the quality control of folding in the ER was adequate in the mutant strain. Surprisingly, the ss14_Cnx1p mutant is composed of the 160 N-terminal amino acids of the mature molecule, thus this mutant defines a novel calnexin/Cnx1p region supporting Sz. pombe viability. Interestingly, like viable mutants spanning the last 52 aa of calnexin/Cnx1p, the 160 N-terminal residues encoded by ss14_cnx1 also forms a complex with the essential BiP chaperone. These results reveal the so far unidentified importance of the N-terminal region of calnexin/Cnx1p.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,071
Score d'incertitude au seuil0,357

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle