The 160 <i>N</i>‐terminal residues of calnexin define a novel region supporting viability in <i>Schizosaccharomyces pombe</i>
Notice bibliographique
Résumé
Protein secretion is a complex process that can be modulated by folding factors in the endoplasmic reticulum (ER), such as calnexin, a highly-conserved molecular chaperone involved in quality control. In Schizosaccharomyces pombe, calnexin (Cnx1p) is essential for cell viability. The calnexin/Cnx1p determinants required for viability have been mapped within the last 123 residues of its C-terminus. To better understand the role(s) of calnexin/Cnx1p in secretion, we screened for cnx1 mutants 'super-secreting' cellulase. We identified ss14_cnx1, a mutant secreting 10-fold higher levels of the glycoprotein cellulase than the wild-type strain. While cellulase did not interact with ss14_Cnx1p, the ratio of secreted activity/quantity for this enzyme was not affected, suggesting that the quality control of folding in the ER was adequate in the mutant strain. Surprisingly, the ss14_Cnx1p mutant is composed of the 160 N-terminal amino acids of the mature molecule, thus this mutant defines a novel calnexin/Cnx1p region supporting Sz. pombe viability. Interestingly, like viable mutants spanning the last 52 aa of calnexin/Cnx1p, the 160 N-terminal residues encoded by ss14_cnx1 also forms a complex with the essential BiP chaperone. These results reveal the so far unidentified importance of the N-terminal region of calnexin/Cnx1p.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».