Tomato Phenylalanine Ammonia-Lyase Gene Family, Highly Redundant but Strongly Underutilized
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Phenylalanine ammonia-lyase (PAL) is an important enzyme in both plant development and pathogen defense. In all plants it is encoded by a multi-gene family, ranging in copy number from four in Arabidopsis to a dozen or more copies in some higher plants. Many studies indicate that alternate genes are differentially regulated in response to environmental stimuli. In this study, Southern blot and dot blot analyses in tomato indicate a surprisingly large family of related sequences with approximately 26 copies in the diploid genome, some easily distinguished by restriction enzyme digestion. Analyses of a BAC genome library suggest that the genes are generally not clustered. A more detailed comparison of the gene sequences using PCR to isolate the individual copies and reverse transcription-PCR to study the transcripts that they encode indicates a significant diversity in the gene sequences themselves, but surprisingly only one mRNA transcript can be detected even when additional expression is induced by pathogen growth or wounding. Consistent with previous reports in other plants, a parallel study with a closely related plant, the potato, indicates a much broader utilization of the PAL genes, highlighting the unusual nature of this family in tomato and of the mechanism(s) that silences so many members. Plant transformation analyses further demonstrate the presence of very active silencing, suggesting aggressive competition between PAL gene duplication and copy inactivation during PAL gene evolution.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle