ACC deaminase genes are conserved among<i>Mesorhizobium</i>species able to nodulate the same host plant
Notice bibliographique
Résumé
Rhizobia strains expressing the enzyme 1-aminocyclopropane-1-carboxylate (ACC) deaminase have been reported to display an augmented symbiotic performance as a consequence of lowering the plant ethylene levels that inhibit the nodulation process. Genes encoding ACC deaminase (acdS) have been studied in Rhizobium spp.; however, not much is known about the presence of acdS genes in Mesorhizobium spp. The aim of this study was to assess the prevalence and phylogeny of acdS genes in Mesorhizobium strains including a collection of chickpea-nodulating mesorhizobia from Portugal. ACC deaminase genes were detected in 10 of 12 mesorhizobia type strains as well as in 18 of 18 chickpea Mesorhizobium isolates studied in this work. No ACC deaminase activity was detected in any Mesorhizobium strain tested under free-living conditions. Despite the lack of ACC deaminase activity, it was possible to demonstrate that in Mesorhizobium ciceri UPM-Ca7(T) , the acdS gene is transcribed under symbiotic conditions. Phylogenetic analysis indicates that strains belonging to different species of Mesorhizobium, but nodulating the same host plant, have similar acdS genes, suggesting that acdS genes are horizontally acquired by transfer of the symbiosis island. This data, together with analysis of the symbiosis islands from completely sequenced Mesorhizobium genomes, suggest the presence of the acdS gene in a Mesorhizobium common ancestor that possessed this gene in a unique symbiosis island.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».