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Enregistrement W2035422545 · doi:10.1242/dev.00669

Spatial and temporal patterns of ERK signaling during mouse embryogenesis

2003· article· en· W2035422545 sur OpenAlexaff
Laura Corson, Yojiro Yamanaka, Ka‐Man Venus Lai, Janet Rossant

Notice bibliographique

RevueDevelopment · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDevelopmental Biology and Gene Regulation
Établissements canadiensUniversity of TorontoLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyMAPK/ERK pathwayCell biologyFibroblast growth factorReceptor tyrosine kinaseSignal transductionFGF8Fibroblast growth factor receptorReceptorGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Signaling between tissues is essential to form the complex, three-dimensional organization of an embryo. Because many receptor tyrosine kinases signal through the RAS-MAPK pathway, phosphorylated ERK can be used as an indicator of when and where signaling is active during development. Using whole-mount immunohistochemistry with antibodies specific to phosphorylated ERK1 and ERK2, we analyzed the location, timing, distribution, duration and intensity of ERK signaling during mouse embryogenesis (5-10.5 days postcoitum). Spatial and temporal domains of ERK activation were discrete with well-defined boundaries, indicating specific regulation of signaling in vivo. Prominent, sustained domains of ERK activation were seen in the ectoplacental cone, extra-embryonic ectoderm, limb buds, branchial arches, frontonasal process, forebrain, midbrain-hindbrain boundary, tailbud, foregut and liver. Transient activation was seen in neural crest, peripheral nervous system, nascent blood vessels, and anlagen of the eye, ear and heart. In the contiguous domains of ERK signaling, phospho-ERK staining was cytoplasmic with no sign of nuclear translocation. With few exceptions, the strongest domains of ERK activation correlated with regions of known or suspected fibroblast growth factor (FGF) signaling, and brief incubation with an inhibitor of the fibroblast growth factor receptor (FGFR) specifically diminished the phospho-ERK staining in these regions. Although many domains of ERK activation were FGFR-dependent, not all domains of FGF signaling were phospho-ERK positive. These studies identify key domains of sustained ERK signaling in the intact mouse embryo, give significant insight into the regulation of this signaling in vivo and pinpoint regions where downstream target genes can be sought.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,207
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations390
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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