A pharmacogenomics study of the human estrogen glucuronosyltransferase UGT1A3
Notice bibliographique
Résumé
UGT1A3 is one of the most efficient at conjugating estrone, a precursor for biosynthesis of estradiol in peripheral tissues. We established the genetic mechanisms that might contribute to individual variation in UGT1A3 expression and activity. UGT1A3 first exon and 5'-flanking regions were sequenced in 249 Caucasians. We identified 17 polymorphisms, among them seven regulatory and 10 exonic polymorphisms with six leading to amino-acid changes. Luciferase reporter assays, site-directed mutagenesis and electrophoretic mobility shift assays using hepatoma HepG2 cells were carried out to show functionality of variant promoters. Reduced transcriptional activity was associated with all six variant promoters (two-fold; P<0.001). One of the potential mechanisms would involve the -148 T>C and -581 C>T variations that modulate gene function by affecting hepatocyte nuclear factor-1alpha and hepatocyte nuclear factor-4alpha binding, respectively. Then, estrone-conjugating activity was assessed with 11 heterologously expressed allozymes. Three phenotypes were observed; UGT1A3*1, *2 (WR, VA) and *3 (WR) with high intrinsic clearance values; UGT1A3*5 (QR, WR), *7 (FI), *9 (WR, ML), *10 (VA) and *11 (WR, VA and MI) had intermediate CLint (2X-10X lower vs. *1), whereas UGT1A3*4 (RW), *6 (WR, VA, MV) and *8 (AV) had low CLint (>10X lower vs. *1). Diplotype analyses indicate that 20.1% of individuals carry two alleles affecting UGT1A3 expression and/or activity. This study did not investigate genotype-phenotype association, but raise the possibility that genetically determined variation might contribute to variability in the inactivation of estrone by UGT1A3 and subsequent changes in lifetime exposure to estrogens potentially modifying risk of cancer.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».