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Enregistrement W2035487812 · doi:10.1017/s0950268806006868

Evaluation of enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) tests and culture for determining <i>Salmonella</i> status of a pig herd

2006· article· en· W2035487812 sur OpenAlexafffundabout
Abdolvahab Farzan, Robert Friendship, Catherine E. Dewey

Notice bibliographique

RevueEpidemiology and Infection · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSalmonella and Campylobacter epidemiology
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesHealth CanadaPublic Health AgencyPublic Health Agency of Canada
Mots-clésSalmonellaHerdEnzymeMicrobiologyBiologyVirologyVeterinary medicineMedicineAnimal scienceBacteriaBiochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The purpose of this study was to evaluate Salmonella ELISA tests and a culture technique to determine Salmonella status using samples collected from commercial herds. Faecal samples from 15 finisher pigs on each of 40 swine farms were cultured for Salmonella. Sera from the same 600 pigs were analysed for the presence of antibodies to Salmonella by means of two different ELISA kits Salmotype (Salmotype Labordiagnostik, Leipzig, Germany) and IDEXX (Herdchek* Salmonella; IDEXX Laboratories, Schiphol-Rijk, Noord-Holland, The Netherlands). The Salmotype ELISA test demonstrated a moderate ability to differentiate culture-positive pigs from culture-negative pigs while IDEXX was relatively poor in classifying those pigs correctly (The area under the curves were 0.79 and 0.65 for Salmotype and IDEXX respectively). The maximum value of sensitivity plus specificity was gained at the cut-off optical density (OD) > or =25% for Salmotype (sensitivity 0.65, specificity 0.84) and at the OD > or =9% for IDEXX (sensitivity 0.59, specificity 0.69). The maximum herd sensitivity and herd specificity was 0.64 (95% CI 0.49-0.79) and 0.72 (95% CI 0.59-0.86) for the Salmotype test and 0.73 (95% CI 0.59-0.87) and 0.62 (95% CI 0.47-0.77) for the IDEXX. Culture and the ELISA tests showed fair agreement at the herd level (kappa=0.3, P<0.05). Likewise there was significant disagreement between the two ELISA tests at the pig level, but very good agreement between the two ELISA tests (kappa=0.8, P<0.0001) at the herd level. The coating antigens in Salmotype and IDEXX represent only 48% of the antigens of Salmonella isolated in our study and need to be revised based upon the Salmonella serovar distribution in Ontario.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,255
Score d'incertitude au seuil0,318

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,067
Tête enseignante GPT0,320
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations40
Publié2006
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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