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Enregistrement W2035539104 · doi:10.1038/sj.jim.7000046

Development of a method for the application of solid-phase microextraction to monitor biodegradation of volatile hydrocarbons during bacterial growth on crude oil

2000· article· en· W2035539104 sur OpenAlexafffund
Jonathan D. Van Hamme, O. P. Ward

Notice bibliographique

RevueJournal of Industrial Microbiology & Biotechnology · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial bioremediation and biosurfactants
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of Waterloo
Mots-clésBiodegradationChromatographySolid-phase microextractionFlame ionization detectorLaboratory flaskChemistryGas chromatographyMicrobial biodegradationMass spectrometryGas chromatography–mass spectrometryMicroorganismBacteriaOrganic chemistryBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A quantitative solid-phase microextraction, gas chromatography, flame ionization detector (SPME-GC-FID) method for low-molecular-weight hydrocarbons from crude oil was developed and applied to live biodegradation samples. Repeated sampling was achieved through headspace extractions at 30°C for 45 min from flasks sealed with Teflon Mininert. Quantification without detailed knowledge of oil–water–air partition coefficients required the preparation of standard curves. An inverse relationship between retention time and mass accumulated on the SPME fibre was noted. Hydrocarbons from C5 to C16 were dated and those up to C11 were quantified. Total volatiles were quantified using six calibration curves. Biodegradation of volatile hydrocarbons during growth on crude oil was faster and more complete with a mixed culture than pure isolates derived therefrom. The mixed culture degraded 55% of the compounds by weight in 4 days versus 30–35% by pure cultures of Pseudomonas aeruginosa, Rhodococcus globerulus or a co-culture of the two. The initial degradation rate was threefold higher for the mixed culture, reaching 45% degradation after 48 h. For the mixed culture, the degradation rate of individual alkanes was proportional to the initial concentration, decreasing from hexane to undecane. P. fluorescens was unable to degrade any of the low-molecular-weight hydrocarbons and methylcyclohexane was recalcitrant in all cases. Overall, the method was found to be reliable and cost-effective. Journal of Industrial Microbiology & Biotechnology (2000) 25, 155–162.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2000
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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