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Enregistrement W2035745977 · doi:10.1111/vox.12207

<scp>PCR</scp>‐free blood group genotyping using a nanobiosensor

2014· article· en· W2035745977 sur OpenAlexafffund
Danny Brouard, Olivier Ratelle, Josée Perreault, Denis Boudreau, M. St‐Louis

Notice bibliographique

RevueVox Sanguinis · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueBiosensors and Analytical Detection
Établissements canadiensUniversité LavalHéma-Québec
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésGenotypingFlow cytometryDNAgenomic DNAMolecular biologyBiologySNP genotypingWhole bloodGenotypeGeneticsGeneImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND AND OBJECTIVES: The last two decades have seen major developments in genotyping assays to facilitate the procurement of red blood cell units to alloimmunized patients. To make genotyping faster, simpler and less costly, a nanotechnology approach based on metal/silica fluorescent nanoparticles and a polymer-based hybridization optical transducer was designed. The objectives of this study were (1) to verify whether this nanobiosensor has the ability to discriminate single nucleotide polymorphisms in non-amplified genomic DNA and (2) to establish whether the signal generated by the nanobiosensor is sufficiently intense to be detected by standard flow cytometry. MATERIALS AND METHODS: Silver-core silica-shell fluorescent nanoparticles (Ag@SiO₂) were prepared, and amine-modified DNA probes were grafted to their surface. A cationic conjugated polymer was electrostatically bound to the surface probes to become optically active upon hybridization with a target. Two nanobiosensor formulations specific to DO*01 and DO*02 alleles were prepared. DNA was extracted from whole blood and mixed with the nanobiosensor for hybridization. The nanobiosensor fluorescence was measured by flow cytometry. RESULTS: Nine volunteers were typed for Dombrock blood group antigens DO*01 and DO*02. A statistically significant increase in the optical transduction signal was observed for sequence-specific samples. All nine genotypes were correctly identified when compared to standardized PCR assays. CONCLUSION: The nanobiosensor provides rapid and simple genotyping of blood group antigens from unamplified genomic DNA and can be measured using standard flow cytometers. This PCR-free approach could be applied to any known genetic polymorphism.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,745
Score d'incertitude au seuil0,906

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,193
Écart entre enseignants0,183 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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