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Enregistrement W2035811309 · doi:10.1186/1472-6890-10-1

SNAI1 expression and the mesenchymal phenotype: an immunohistochemical study performed on 46 cases of oral squamous cell carcinoma

2010· article· en· W2035811309 sur OpenAlexafffund
Joerg Schwock, Grace Bradley, Jcm Ho, Bayardo Perez‐Ordoñez, David W. Hedley, Jonathan C. Irish, William R. Geddie

Notice bibliographique

RevueBMC Clinical Pathology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCell Adhesion Molecules Research
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteUniversity of TorontoUniversity Health Network
Mots-clésSNAI1MedicineImmunohistochemistryPathologyEpithelial–mesenchymal transitionMetastasisCancer researchContext (archaeology)PhenotypeMesenchymal stem cellVimentinFocal adhesionCancerCellInternal medicineBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: SNAI1 can initiate epithelial-mesenchymal transition (EMT), leading to loss of epithelial characteristics and, in cancer, to invasion and metastasis. We hypothesized that SNAI1 reactivation occurs in oral squamous cell carcinoma (OSCC) where it might also be associated with focal adhesion kinase (FAK) expression and p63 loss. METHODS: Immunohistochemistry was performed on 46 tumors and 26 corresponding lymph node metastases. Full tissue sections were examined to account for rare and focal expression. Clinical outcome data were collected and analyzed. RESULTS: SNAI1-positivity (nuclear, >/= 5% tumor cells) was observed in 10 tumors and 5 metastases (n = 12 patients). Individual SNAI1(+) tumor cells were seen in primary tumors of 30 patients. High level SNAI1 expression (>10% tumor cells) was rare, but significantly associated with poor outcome. Two cases displayed a sarcomatoid component as part of the primary tumor with SNAI1(+)/FAK(+)/E-cadherin(-)/p63(-) phenotype, but disparate phenotypes in corresponding metastases. All cases had variable SNAI1(+) stroma. A mesenchymal-like immunoprofile in primary tumors characterized by E-cadherin loss (n = 29, 63%) or high cytoplasmic FAK expression (n = 10, 22%) was associated with N(+) status and tumor recurrence/new primary, respectively. CONCLUSIONS: SNAI1 is expressed, although at low levels, in a substantial proportion of OSCC. High levels of SNAI1 may herald a poor prognosis and circumscribed SNAI1 expression can indicate the presence of a sarcomatoid component. Absence of p63 in this context does not exclude squamous tumor origin. Additional EMT inducers may contribute to a mesenchymal-like phenotype and OSCC progression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,071
Tête enseignante GPT0,404
Écart entre enseignants0,334 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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