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Enregistrement W2035859404 · doi:10.2527/jas.2009-1967

Perineal swabs reveal effect of super shedders on the transmission of Escherichia coli O157:H7 in commercial feedlots1

2009· article· en· W2035859404 sur OpenAlexaffabout
T.P. Stephens, Tim A. McAllister, Kim Stanford

Notice bibliographique

RevueJournal of Animal Science · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food CanadaAgriculture Food and Rural Development
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFecesFeedlotBiologyAnimal scienceVeterinary medicineEscherichia coliAgarMicrobiologyBacteriaMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cattle that shed more than 10(4) cfu/g of Escherichia coli O157 in feces have been described as super shedders (SS) and are thought to have major impacts on prevalence and transmission of this organism. Two Southern Alberta commercial feedlots (feedlot X, 7 pens averaging 183 steers; feedlot Y, 5 pens averaging 153 steers) were sampled from May 2007 to January 2008. Background samples [fecal pat (FP) water, ropes] were taken weekly from each pen for 2 wk before collection of samples from individuals [fecal grab (FG); perineal swab] at 2 different times [during spring and summer (S1); immediately before slaughter during fall and winter (S2)]. Immunomagnetic separation and selective media were used for detecting E. coli O157:H7. Positive FG and FP were enumerated by direct plating onto sorbitol MacConkey agar supplemented with 2.5 mg/L of potassium tellurite and 0.05 mg/L of cefixime. Five sorbitol-negative colonies were agglutinated using an anti-O157 latex kit, and the proportion of positive colonies was adjusted for non-E. coli O157:H7. Overall, there were 153 (7.16%) and 10 (0.45%) SS at S1 and S2, respectively. In feedlot X, SS and penmates of SS during S1 were more likely (P < 0.01) to shed E. coli O157:H7 in their feces and have this organism on their perineum than cattle in a pen where no SS were identified. In feedlot Y, SS and penmates of SS during S1 were more likely (P < 0.01) to have E. coli O157:H7 on their perineum than those from a pen where only 1 SS was identified, but steers in only 1 pen with multiple SS were more likely (P < 0.01) to shed this organism in feces. Overall, E. coli O157:H7 was 1.85 times more likely (P < 0.01) to be detected in perineal swabs compared with FG and E. coli O157:H7 was more likely (P < 0.01) to be detected at S1 compared with S2 for all sample types. Super shedders were a larger proportion of shedding cattle in S1 than in S2, but the presence of SS increased (P < 0.01) prevalence of this organism on the perineum of cattle throughout the year. Even when SS did not increase fecal shedding of E. coli O157:H7, their presence increased contamination of hides, an outcome that could have important implications for contamination of carcasses at the abattoir.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,302
Score d'incertitude au seuil0,267

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,305
Écart entre enseignants0,292 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations62
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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