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Enregistrement W2036043878 · doi:10.1111/mec.13117

Genetic reconstructions of invasion history

2015· review· en· W2036043878 sur OpenAlexafffund
Melania E. Cristescu

Notice bibliographique

RevueMolecular Ecology · 2015
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyEvolutionary biologyPopulation genomicsPopulationPhylogeographyGenomicsBiodiversityPopulation geneticsGene flowEcologyGenetic variationGenomePhylogeneticsGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A diverse array of molecular markers and constantly evolving analytical approaches have been employed to reconstruct the invasion histories of the most notorious invasions. Detailed information on the source(s) of introduction, invasion route, type of vectors, number of independent introductions and pathways of secondary spread has been corroborated for a large number of biological invasions. In this review, I present the promises and limitations of current techniques while discussing future directions. Broad phylogeographic surveys of native and introduced populations have traced back invasion routes with surprising precision. These approaches often further clarify species boundaries and reveal complex patterns of genetic relationships with noninvasive relatives. Moreover, fine-scale analyses of population genetics or genomics allow deep inferences on the colonization dynamics across invaded ranges and can reveal the extent of gene flow among populations across various geographical scales, major demographic events such as genetic bottlenecks as well as other important evolutionary events such as hybridization with native taxa, inbreeding and selective sweeps. Genetic data have been often corroborated successfully with historical, geographical and ecological data to enable a comprehensive reconstruction of the invasion process. The advent of next-generation sequencing, along with the availability of extensive databases of repository sequences generated by barcoding projects opens the opportunity to broadly monitor biodiversity, to identify early invasions and to quantify failed invasions that would otherwise remain inconspicuous to the human eye.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations224
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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